259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3853 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3853  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
384 aa  759    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.208611  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1361  Glycosyltransferase-like protein  59.05 
 
 
373 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0377  Glycosyltransferase-like protein  56.08 
 
 
362 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.855728  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0163  group 1 glycosyl transferase  54.7 
 
 
362 aa  343  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.239921  normal  0.204374 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0726  group 1 glycosyl transferase  50.41 
 
 
372 aa  277  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26790  glycosyltransferase  45.65 
 
 
387 aa  245  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
373 aa  117  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
372 aa  99.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
392 aa  97.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4496  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7632  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
368 aa  79.3  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164329  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  21.63 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1825  glycosyl transferase group 1  23.01 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  34.73 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3949  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 
367 aa  69.7  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.256853  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  24.11 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  32 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.54 
 
 
403 aa  63.9  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  34.5 
 
 
374 aa  63.2  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
382 aa  62.8  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0391  glycosyl transferase, group 1  21.33 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999016  normal  0.0192466 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
387 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
410 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
414 aa  60.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 
402 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
396 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
396 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  23.51 
 
 
401 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 
416 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 
385 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
387 aa  58.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
426 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  20.83 
 
 
413 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
393 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
394 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
396 aa  57.4  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 
386 aa  56.6  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
413 aa  56.2  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
414 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  20.69 
 
 
350 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
417 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
339 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.03 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
387 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
403 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
376 aa  53.5  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.32 
 
 
377 aa  53.1  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  25.28 
 
 
377 aa  53.5  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.28 
 
 
380 aa  53.1  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  23.22 
 
 
420 aa  53.1  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
346 aa  53.1  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 
463 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
412 aa  52.8  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  22.63 
 
 
395 aa  53.1  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09040  glycosyltransferase  33.94 
 
 
861 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.892968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
371 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  22.73 
 
 
375 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.11 
 
 
406 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
409 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 
358 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1692  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
401 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  32.24 
 
 
557 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  22.68 
 
 
420 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  25.43 
 
 
402 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.11 
 
 
406 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1003  hypothetical protein  24.62 
 
 
416 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 
397 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
398 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
408 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4492  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
399 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0132524  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.7 
 
 
413 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  21.7 
 
 
413 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 
422 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
402 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.31 
 
 
406 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.11 
 
 
406 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
396 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.7 
 
 
413 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
434 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 
384 aa  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.12 
 
 
775 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  37.35 
 
 
390 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  37.35 
 
 
390 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0355  glycosyl transferase, group 1  20.15 
 
 
375 aa  49.7  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1732  putative glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 
424 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
409 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  24.27 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
388 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
704 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>