192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0726 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0726  group 1 glycosyl transferase  100 
 
 
372 aa  725    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1361  Glycosyltransferase-like protein  60.11 
 
 
373 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3853  glycosyl transferase group 1  50.41 
 
 
384 aa  319  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.208611  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0163  group 1 glycosyl transferase  47.03 
 
 
362 aa  285  7e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.239921  normal  0.204374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0377  Glycosyltransferase-like protein  47.7 
 
 
362 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.855728  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26790  glycosyltransferase  38.66 
 
 
387 aa  191  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
381 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
385 aa  103  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4496  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
374 aa  97.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
372 aa  83.6  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  23.3 
 
 
373 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7632  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164329  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  36.76 
 
 
569 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  36.67 
 
 
557 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.58 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
375 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
405 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  22.68 
 
 
399 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  20 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
409 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
396 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  36.26 
 
 
374 aa  62.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3949  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
367 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.256853  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.98 
 
 
403 aa  60.5  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
394 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 
387 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
393 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  36.09 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
376 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
412 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 
411 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 
386 aa  57  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 
413 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 
416 aa  56.6  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
390 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  35.44 
 
 
372 aa  56.2  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.81 
 
 
377 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  30.85 
 
 
416 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  37.24 
 
 
417 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.88 
 
 
413 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  23.88 
 
 
413 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.88 
 
 
413 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 
402 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
405 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
405 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
414 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 
441 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 
517 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1489  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
395 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113053  normal  0.618426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
350 aa  52.8  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  27.22 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  21.37 
 
 
395 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
385 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  24.41 
 
 
377 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.41 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 
420 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
359 aa  51.2  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
704 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4245  glycosyl transferase group 1  33.93 
 
 
414 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4220  glycosyl transferase group 1  33.93 
 
 
414 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
360 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
407 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  46.67 
 
 
415 aa  49.7  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08970  glycosyltransferase  32.63 
 
 
601 aa  49.7  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
398 aa  49.7  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1588  glycosyl transferase group 1  22.58 
 
 
374 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603686  normal  0.0564802 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  26.54 
 
 
406 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  32.05 
 
 
404 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  24.48 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4095  glycosyl transferase, group 1  33.93 
 
 
414 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166575  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4345  glycosyl transferase, group 1  43.28 
 
 
447 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0391  glycosyl transferase, group 1  19.19 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999016  normal  0.0192466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
422 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  28.5 
 
 
378 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  26.54 
 
 
406 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
408 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  26.75 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
445 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.33 
 
 
377 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  26.07 
 
 
396 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  27.66 
 
 
398 aa  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  26.38 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
400 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0077  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
373 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  36.04 
 
 
412 aa  47.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
403 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  25.13 
 
 
564 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 
387 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 
412 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
374 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
399 aa  47.4  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>