More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0588 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 377 aa  772    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.92 
 
 		 377 aa  333  4e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  44.35 
 
 		 388 aa  331  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  47.2 
 
 		 376 aa  325  7e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  44.09 
 
 		 371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  38.03 
 
 		 382 aa  266  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  38.27 
 
 		 387 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  36.6 
 
 		 377 aa  251  1e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.6 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  34.58 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 		 386 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  36.17 
 
 		 379 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 		 396 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.63 
 
 		 341 aa  229  6e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  35.25 
 
 		 387 aa  229  7e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  42.8 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 		 385 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.4 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  34.04 
 
 		 374 aa  209  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  34.94 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.24 
 
 		 385 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.24 
 
 		 378 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.24 
 
 		 385 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.24 
 
 		 378 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.24 
 
 		 385 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.24 
 
 		 385 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.24 
 
 		 385 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.53 
 
 		 378 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  31.93 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  34.15 
 
 		 374 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 		 382 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  32.5 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  29.33 
 
 		 377 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  29.07 
 
 		 377 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 		 381 aa  191  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  30.52 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 		 378 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 		 378 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  32.4 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 		 378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 		 373 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  32.25 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 		 382 aa  176  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 		 404 aa  176  9e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  33.44 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 382 aa  169  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 		 385 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 		 381 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  30.43 
 
 		 598 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 		 389 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 		 382 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 379 aa  159  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 		 384 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 374 aa  155  8e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 387 aa  150  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 		 390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  27.63 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  28.01 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  29.61 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  29.09 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  29.61 
 
 		 376 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 		 379 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 379 aa  133  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  26.46 
 
 		 378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  25 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  27.06 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  36.76 
 
 		 148 aa  105  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  26.79 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  37.7 
 
 		 386 aa  96.7  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 387 aa  96.3  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 		 378 aa  93.2  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 		 398 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 387 aa  89.7  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 422 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1806  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 422 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5246  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 385 aa  86.3  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 		 377 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 376 aa  86.3  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>