More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001768 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 383 aa  787    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  47.47 
 
 		 379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  46.36 
 
 		 373 aa  350  3e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  43.28 
 
 		 384 aa  302  8.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  41.46 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  44.8 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  42.74 
 
 		 372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  39.1 
 
 		 598 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  38.93 
 
 		 375 aa  271  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  38.77 
 
 		 374 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  38.67 
 
 		 371 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 408 aa  260  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  35.75 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  36.8 
 
 		 382 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  35.81 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  38.33 
 
 		 371 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  36.14 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  36.07 
 
 		 382 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  36.51 
 
 		 382 aa  226  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.15 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.15 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.15 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.88 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  35.15 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.15 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.15 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.15 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 		 378 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 		 378 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.88 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  35.73 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 		 378 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.04 
 
 		 377 aa  203  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.59 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  35.59 
 
 		 377 aa  200  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 		 378 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 		 378 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  34.89 
 
 		 369 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  34.37 
 
 		 382 aa  193  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  34.6 
 
 		 376 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 		 362 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  32.15 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  32.72 
 
 		 371 aa  178  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 		 388 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.86 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.27 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 		 396 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 394 aa  163  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  31.29 
 
 		 386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  31.64 
 
 		 376 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  32.7 
 
 		 371 aa  160  5e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  30.9 
 
 		 376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  31.07 
 
 		 376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  32.57 
 
 		 374 aa  149  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 		 379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  29.41 
 
 		 375 aa  138  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  27.98 
 
 		 370 aa  139  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  35.35 
 
 		 339 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  29.28 
 
 		 371 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  26.37 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 399 aa  119  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  29.62 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  26.57 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  26.27 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.15 
 
 		 377 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 		 382 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 385 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  41.43 
 
 		 148 aa  107  3e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 		 389 aa  106  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 		 409 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  23.37 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 		 388 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  35.98 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 		 387 aa  97.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 379 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 		 387 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 379 aa  92.8  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 377 aa  92.8  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 360 aa  91.3  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>