More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5353 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
379 aa  723    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  74.74 
 
 
385 aa  508  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  75.4 
 
 
389 aa  501  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  76.13 
 
 
382 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  85.22 
 
 
379 aa  497  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  76.82 
 
 
387 aa  485  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  38.07 
 
 
394 aa  258  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  41.16 
 
 
386 aa  219  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  38.9 
 
 
379 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.56 
 
 
380 aa  209  4e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  34.75 
 
 
377 aa  209  5e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  37.83 
 
 
387 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.03 
 
 
341 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  37.27 
 
 
376 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  41.26 
 
 
374 aa  196  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  36.78 
 
 
382 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.65 
 
 
377 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
396 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  33.59 
 
 
388 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.29 
 
 
377 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  34.69 
 
 
385 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
387 aa  176  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  31.73 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.44 
 
 
377 aa  155  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  27.65 
 
 
377 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  34.85 
 
 
382 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  27.65 
 
 
377 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  32.68 
 
 
371 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 
381 aa  143  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
373 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  36.67 
 
 
372 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 
404 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  39.83 
 
 
339 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 
375 aa  134  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  30.95 
 
 
382 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.42 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.42 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.42 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.42 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.42 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.42 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.42 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  34.94 
 
 
598 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 
390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  30.96 
 
 
371 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  34.72 
 
 
374 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.76 
 
 
378 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  32.6 
 
 
378 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
378 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 
378 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
383 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
378 aa  123  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  26.29 
 
 
378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  33.6 
 
 
379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 
374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 
379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  25.36 
 
 
375 aa  113  5e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  34.87 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  27.12 
 
 
371 aa  110  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
381 aa  109  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  27.52 
 
 
371 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  23.91 
 
 
376 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  23.58 
 
 
376 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  23.27 
 
 
369 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 
390 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
375 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  24.4 
 
 
370 aa  102  9e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  22.83 
 
 
376 aa  101  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  19.78 
 
 
362 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  22.89 
 
 
371 aa  88.6  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
399 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
409 aa  79.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  32.54 
 
 
148 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  23.71 
 
 
383 aa  78.2  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
350 aa  77  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  31.7 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 
505 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.69 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  35.07 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  31.94 
 
 
363 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  33.52 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  41.03 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  38.71 
 
 
419 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  46.88 
 
 
414 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  39.25 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  40.54 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  27.53 
 
 
366 aa  69.3  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>