More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1527 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  100 
 
 		 371 aa  748    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  46.36 
 
 		 371 aa  331  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  45.01 
 
 		 384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  40.53 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  45.05 
 
 		 374 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  40.81 
 
 		 404 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  41.98 
 
 		 373 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  40.59 
 
 		 408 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  39.26 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  44.12 
 
 		 598 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.54 
 
 		 378 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.54 
 
 		 385 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.54 
 
 		 378 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.54 
 
 		 385 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.54 
 
 		 385 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.54 
 
 		 385 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.54 
 
 		 385 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  43.21 
 
 		 372 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.71 
 
 		 378 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  38.92 
 
 		 381 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  38.33 
 
 		 383 aa  250  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  39.18 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  38.38 
 
 		 390 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  38.92 
 
 		 378 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  39.23 
 
 		 382 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  38.81 
 
 		 378 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 		 379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  38.54 
 
 		 378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  38.54 
 
 		 378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  38.67 
 
 		 378 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  38.67 
 
 		 378 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  38.95 
 
 		 378 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  35.73 
 
 		 375 aa  228  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  33.43 
 
 		 369 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 		 374 aa  215  8e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  35.85 
 
 		 381 aa  209  5e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 		 382 aa  205  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 		 381 aa  199  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  32.44 
 
 		 377 aa  195  9e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.44 
 
 		 380 aa  195  9e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  36.16 
 
 		 396 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.52 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.12 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  37.07 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  32.78 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 		 387 aa  179  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  40.2 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  35.2 
 
 		 381 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  34.99 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  34.14 
 
 		 387 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  36.7 
 
 		 379 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  30.25 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  32.94 
 
 		 371 aa  166  5e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 388 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.19 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  31.83 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 		 390 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  32.08 
 
 		 371 aa  158  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  35.39 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  30.16 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 399 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  27 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  26.02 
 
 		 370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 		 385 aa  126  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  27.81 
 
 		 371 aa  126  7e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  27.99 
 
 		 375 aa  125  8.000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  26.46 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  26.85 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  26.61 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.33 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  37.44 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  26.61 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 		 387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 		 389 aa  103  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  43.24 
 
 		 148 aa  100  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 386 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  26.53 
 
 		 383 aa  99.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 		 362 aa  93.2  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 		 382 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 374 aa  89.7  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 364 aa  89.7  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  30.9 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 		 374 aa  86.7  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>