More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0670 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
371 aa  761    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  47.97 
 
 
388 aa  354  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.5 
 
 
377 aa  350  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  48.24 
 
 
376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  43.32 
 
 
382 aa  324  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  45.01 
 
 
387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.09 
 
 
377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.09 
 
 
380 aa  306  3e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  43.09 
 
 
377 aa  306  3e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  37.77 
 
 
385 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  37.37 
 
 
387 aa  243  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  37.94 
 
 
386 aa  239  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
394 aa  238  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.24 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 
396 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  37.3 
 
 
379 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  35.8 
 
 
371 aa  210  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.61 
 
 
377 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  44.05 
 
 
339 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  36.04 
 
 
374 aa  205  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
404 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  31 
 
 
377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  35.33 
 
 
374 aa  199  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  30.73 
 
 
377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 
378 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
378 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 
378 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 
381 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  31.42 
 
 
378 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
373 aa  189  7e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 
372 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
378 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
382 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.41 
 
 
385 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.41 
 
 
385 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.41 
 
 
385 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.41 
 
 
385 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.41 
 
 
378 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.41 
 
 
378 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.41 
 
 
385 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
378 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.41 
 
 
378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  30.21 
 
 
382 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
378 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 
383 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
382 aa  176  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
385 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  32.94 
 
 
371 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 
379 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  32.01 
 
 
384 aa  166  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 
390 aa  165  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
373 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 
379 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  33.44 
 
 
598 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
381 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  28.38 
 
 
378 aa  160  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
369 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 
375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 
387 aa  149  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
382 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  27.84 
 
 
371 aa  145  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
381 aa  142  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
375 aa  142  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  27.03 
 
 
371 aa  138  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
374 aa  139  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  27.37 
 
 
376 aa  137  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  27.23 
 
 
376 aa  135  9e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  26.84 
 
 
376 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
396 aa  133  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  25.8 
 
 
370 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
379 aa  126  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  27.37 
 
 
375 aa  124  4e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  27.6 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
362 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
379 aa  109  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
379 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  30.29 
 
 
383 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
387 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
385 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
381 aa  99.8  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
413 aa  99.4  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 
422 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
422 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  25.2 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
387 aa  88.6  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
362 aa  88.6  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
379 aa  86.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  23.14 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
410 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>