More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0108 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 382 aa  775    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  59.47 
 
 		 381 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  61.05 
 
 		 373 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  43.24 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  40.37 
 
 		 371 aa  292  7e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  45.41 
 
 		 598 aa  287  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  40.37 
 
 		 373 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  39.26 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  41.32 
 
 		 408 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  41.21 
 
 		 374 aa  262  6.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  41.95 
 
 		 384 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  41.69 
 
 		 372 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  41.84 
 
 		 378 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  41.58 
 
 		 378 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  41.8 
 
 		 378 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  41.58 
 
 		 378 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  41.58 
 
 		 378 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  41.87 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 		 379 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  41.33 
 
 		 378 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  36.14 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.82 
 
 		 385 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.82 
 
 		 385 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.82 
 
 		 385 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.82 
 
 		 385 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.82 
 
 		 385 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.82 
 
 		 378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.82 
 
 		 378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.98 
 
 		 378 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  41.25 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  40.58 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  40.73 
 
 		 382 aa  233  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 		 375 aa  229  5e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  37.73 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  37.8 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.52 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  37.14 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  35.81 
 
 		 379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  36.89 
 
 		 387 aa  213  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.16 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  33.16 
 
 		 377 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  35.03 
 
 		 378 aa  205  8e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 369 aa  203  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  34.31 
 
 		 371 aa  202  7e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.88 
 
 		 341 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  40.12 
 
 		 376 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  31.12 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  34.69 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  36.2 
 
 		 386 aa  182  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  34.46 
 
 		 390 aa  182  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 		 394 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 362 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  27.81 
 
 		 370 aa  176  7e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.34 
 
 		 377 aa  176  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 		 371 aa  176  8e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  28.8 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  28.61 
 
 		 371 aa  160  4e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 		 399 aa  159  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  34.05 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 		 385 aa  156  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  28.96 
 
 		 383 aa  153  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  33.24 
 
 		 396 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  26.05 
 
 		 376 aa  145  9e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  26.32 
 
 		 376 aa  145  9e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  40.62 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 390 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  34.34 
 
 		 374 aa  143  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  26.05 
 
 		 376 aa  143  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  29.14 
 
 		 377 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  29.14 
 
 		 377 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.48 
 
 		 377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 		 403 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  31.81 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 		 389 aa  111  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 408 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  38.24 
 
 		 148 aa  103  5e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 410 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 379 aa  96.7  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 		 364 aa  96.7  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 		 362 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 		 379 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 		 371 aa  92.8  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  26.97 
 
 		 395 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>