More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2263 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 377 aa  775    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  69.87 
 
 		 377 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  69.87 
 
 		 377 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.69 
 
 		 380 aa  229  4e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  33.69 
 
 		 377 aa  229  5e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.4 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 		 371 aa  210  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  31.35 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 		 388 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.02 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 386 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 		 396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.19 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 382 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 		 374 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  26.25 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.76 
 
 		 385 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.76 
 
 		 378 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.76 
 
 		 378 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.76 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.76 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.76 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.76 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.46 
 
 		 378 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 		 387 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 385 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 		 378 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  26.41 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 		 390 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 		 378 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 375 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 		 378 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 		 382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 		 379 aa  126  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  27.46 
 
 		 371 aa  126  7e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 		 373 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 372 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  26.33 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 		 374 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  26.1 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  26.9 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  26.15 
 
 		 374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 379 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 		 383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  26.63 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  26.09 
 
 		 376 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  27.59 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 		 396 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  27.97 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 399 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  26.32 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  22.59 
 
 		 390 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  25.36 
 
 		 598 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  25 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  26.85 
 
 		 371 aa  94  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  22.34 
 
 		 381 aa  93.6  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  29.1 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.73 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  32.62 
 
 		 148 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.92 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>