More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4567 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 408 aa  826    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  45.8 
 
 		 373 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  45.04 
 
 		 384 aa  299  5e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  39.78 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  43.13 
 
 		 404 aa  285  7e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  40.86 
 
 		 379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  44.66 
 
 		 372 aa  277  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  45.07 
 
 		 374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  41.98 
 
 		 598 aa  272  9e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  43.05 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  43.05 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  42.78 
 
 		 378 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  40.59 
 
 		 371 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  40.32 
 
 		 381 aa  266  7e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  41.18 
 
 		 382 aa  265  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  44.11 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  42.51 
 
 		 378 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  41.32 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  43.01 
 
 		 378 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  41.46 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  39.84 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  43.01 
 
 		 378 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 383 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.03 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.03 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.03 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.03 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.03 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.03 
 
 		 378 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.03 
 
 		 378 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.03 
 
 		 378 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  40.22 
 
 		 382 aa  249  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  37.63 
 
 		 381 aa  246  6e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  34.96 
 
 		 375 aa  239  6.999999999999999e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  33.6 
 
 		 374 aa  238  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 		 382 aa  236  8e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.76 
 
 		 377 aa  227  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 		 381 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  36.49 
 
 		 388 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  33.97 
 
 		 377 aa  216  7e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.04 
 
 		 380 aa  215  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.94 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  38.75 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 		 396 aa  206  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  40.19 
 
 		 376 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  35.52 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 		 382 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 		 387 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 369 aa  200  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  36.31 
 
 		 381 aa  196  7e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  32.97 
 
 		 378 aa  190  5e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.18 
 
 		 341 aa  182  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  31.83 
 
 		 390 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 		 371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 		 394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  35.54 
 
 		 386 aa  172  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 362 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 		 379 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  35.6 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  41.18 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  35.47 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  29 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  30.33 
 
 		 371 aa  139  7e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  26.86 
 
 		 376 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  26.37 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  26.37 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  27.47 
 
 		 375 aa  137  5e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.1 
 
 		 377 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  28.1 
 
 		 377 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  27.82 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  27.96 
 
 		 371 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 		 396 aa  126  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  26.02 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  40.71 
 
 		 148 aa  123  7e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  35.81 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  35.51 
 
 		 385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 		 389 aa  119  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  33.56 
 
 		 387 aa  113  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  26.46 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 398 aa  109  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 		 378 aa  93.6  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 		 364 aa  93.2  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  25.28 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 		 377 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 		 360 aa  90.1  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.56 
 
 		 365 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  31.41 
 
 		 346 aa  87  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  24.64 
 
 		 364 aa  87  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  27.62 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>