More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2727 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 403 aa  825    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  45.81 
 
 		 381 aa  343  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  38.95 
 
 		 383 aa  289  7e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  36.04 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 		 390 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 399 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1971  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 		 407 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.341888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3483  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 		 385 aa  146  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0885784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 		 398 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 		 379 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.12 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.12 
 
 		 378 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.12 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.12 
 
 		 378 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.12 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.12 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.12 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.49 
 
 		 378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  30.93 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 		 378 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 		 404 aa  127  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 382 aa  125  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  29.3 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 		 378 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  28.49 
 
 		 377 aa  123  6e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 		 380 aa  123  6e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 378 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  29.75 
 
 		 378 aa  122  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  32.52 
 
 		 372 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  31.55 
 
 		 598 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 		 408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 		 382 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 		 387 aa  110  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 369 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  27.7 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 387 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  27.35 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  30 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  23.65 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  24.57 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.37 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 		 394 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  24.56 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 375 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 369 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 		 374 aa  97.8  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  25.48 
 
 		 376 aa  96.3  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 387 aa  96.3  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  29.02 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  26.9 
 
 		 395 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 362 aa  93.2  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 377 aa  93.2  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 383 aa  92.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 		 364 aa  91.3  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 		 372 aa  91.3  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 		 375 aa  91.3  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 		 382 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.86 
 
 		 419 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 401 aa  90.1  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 		 391 aa  89.7  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.43 
 
 		 401 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  35.03 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1919  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 		 407 aa  87.8  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854337 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 		 374 aa  88.2  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  28.13 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  27.6 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>