More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5664 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
385 aa  770    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  43.2 
 
 
386 aa  291  9e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  41.46 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  42.59 
 
 
387 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  40.91 
 
 
382 aa  261  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  37.77 
 
 
371 aa  250  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.54 
 
 
377 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 
394 aa  245  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  36.76 
 
 
377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.56 
 
 
380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  38.03 
 
 
376 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  36.83 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  37.33 
 
 
396 aa  229  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  38.86 
 
 
374 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  37.47 
 
 
404 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.44 
 
 
377 aa  216  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  35.56 
 
 
379 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.01 
 
 
341 aa  190  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 
379 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  34.5 
 
 
371 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  42.08 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  29.65 
 
 
377 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
387 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 
372 aa  170  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  36.48 
 
 
385 aa  170  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.88 
 
 
385 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.88 
 
 
385 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.88 
 
 
385 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.88 
 
 
385 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.88 
 
 
378 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.88 
 
 
378 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.88 
 
 
385 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 
374 aa  168  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  29.11 
 
 
377 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 
378 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  29.78 
 
 
378 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.11 
 
 
377 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
378 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 
378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 
378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  33.79 
 
 
374 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.9 
 
 
378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  31.41 
 
 
382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  36.2 
 
 
382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  35.6 
 
 
408 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
390 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
382 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 
381 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  35.59 
 
 
381 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 
389 aa  160  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 
382 aa  159  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
381 aa  159  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 
378 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 
378 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
373 aa  156  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
382 aa  156  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
378 aa  155  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 
375 aa  151  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
373 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
383 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 
384 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  31.3 
 
 
598 aa  142  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 
369 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
379 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  26.7 
 
 
376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  30.59 
 
 
371 aa  126  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  26.36 
 
 
376 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 
379 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
390 aa  123  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  26.36 
 
 
376 aa  121  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  25.61 
 
 
371 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
362 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  23.32 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  23.71 
 
 
370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
378 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  24.33 
 
 
375 aa  110  6e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
391 aa  109  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
396 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  21.24 
 
 
371 aa  105  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
398 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
390 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  32.95 
 
 
383 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  23.6 
 
 
384 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
408 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
389 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
362 aa  97.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
366 aa  96.7  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 
403 aa  95.9  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 
361 aa  95.1  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
367 aa  93.2  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
374 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 
380 aa  93.2  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5390  glycosyl transferase, group 1  23.56 
 
 
384 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 
412 aa  92.8  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>