More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0383 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
373 aa  764    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  46.36 
 
 
383 aa  350  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  44.32 
 
 
379 aa  318  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  45.8 
 
 
408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  44.69 
 
 
598 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  44.35 
 
 
374 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  44.09 
 
 
384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  40.53 
 
 
371 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  41.18 
 
 
404 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  40.8 
 
 
373 aa  279  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  39.84 
 
 
371 aa  276  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  44.59 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  40.8 
 
 
381 aa  269  7e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  40.37 
 
 
382 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  36.34 
 
 
374 aa  246  4e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  36.44 
 
 
375 aa  242  9e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
382 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  35.28 
 
 
369 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  36.73 
 
 
381 aa  228  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  38.29 
 
 
378 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  37.74 
 
 
378 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.8 
 
 
378 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.8 
 
 
378 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  37.19 
 
 
378 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.8 
 
 
385 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.8 
 
 
385 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.8 
 
 
385 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.8 
 
 
385 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  37.4 
 
 
382 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  36.91 
 
 
378 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  36.91 
 
 
378 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.8 
 
 
385 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.64 
 
 
378 aa  222  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  36.91 
 
 
378 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  36.53 
 
 
378 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
381 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.93 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.27 
 
 
377 aa  210  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 
382 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  35.8 
 
 
379 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  35.99 
 
 
390 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  34.93 
 
 
388 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  35.33 
 
 
377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.33 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  34.92 
 
 
381 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 
382 aa  189  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
387 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  35.22 
 
 
376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  31.02 
 
 
378 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
386 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
387 aa  170  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
362 aa  166  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
371 aa  164  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.27 
 
 
341 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 
379 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  31.58 
 
 
375 aa  153  5.9999999999999996e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
385 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  36.64 
 
 
339 aa  150  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  27.51 
 
 
376 aa  142  7e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  27.51 
 
 
376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  27.78 
 
 
376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 
374 aa  138  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  26.51 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  26.22 
 
 
377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.79 
 
 
377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  27.13 
 
 
371 aa  125  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  25.27 
 
 
370 aa  120  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  24.87 
 
 
371 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  40.43 
 
 
148 aa  113  5e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
362 aa  110  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  24.14 
 
 
371 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
396 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
399 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 
403 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  28.35 
 
 
383 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
389 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  32.25 
 
 
382 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
385 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 
398 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
379 aa  97.1  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  33.17 
 
 
406 aa  95.9  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
387 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  31.25 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.69 
 
 
406 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.69 
 
 
406 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
390 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.21 
 
 
406 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.21 
 
 
406 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  33.89 
 
 
419 aa  89.7  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1182  putative glycosyl transferase  57.75 
 
 
79 aa  87.4  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.202119  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
364 aa  87.4  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
360 aa  87  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  30.29 
 
 
406 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  30.29 
 
 
406 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  33.99 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>