More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4709 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
396 aa  792    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  63.2 
 
 
387 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  39.47 
 
 
382 aa  293  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.1 
 
 
380 aa  285  7e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  38.03 
 
 
377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  41.29 
 
 
387 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  41.11 
 
 
376 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  37.77 
 
 
394 aa  259  4e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  41.38 
 
 
386 aa  256  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.48 
 
 
341 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  38.06 
 
 
379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.56 
 
 
377 aa  253  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  37.2 
 
 
388 aa  244  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  37.98 
 
 
382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  37.98 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  41.13 
 
 
374 aa  231  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.3 
 
 
377 aa  229  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  35.12 
 
 
371 aa  229  6e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  36.03 
 
 
381 aa  229  8e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  37.33 
 
 
385 aa  229  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  36.97 
 
 
378 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  38.04 
 
 
378 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.23 
 
 
378 aa  226  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.23 
 
 
378 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.23 
 
 
385 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.23 
 
 
378 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.23 
 
 
385 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.23 
 
 
385 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.23 
 
 
385 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.23 
 
 
385 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 
382 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  37.23 
 
 
378 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  36.75 
 
 
390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  37.23 
 
 
378 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  36.44 
 
 
373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  36.68 
 
 
378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  36.68 
 
 
378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  37.91 
 
 
371 aa  220  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  36.68 
 
 
378 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 
404 aa  219  7.999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  36.1 
 
 
381 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  36.31 
 
 
379 aa  208  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  36.2 
 
 
378 aa  207  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
408 aa  206  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  36.53 
 
 
372 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  30.69 
 
 
371 aa  194  3e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  36.16 
 
 
371 aa  193  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  30.05 
 
 
371 aa  192  9e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
379 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  35.79 
 
 
374 aa  190  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  31.48 
 
 
371 aa  189  8e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  46.35 
 
 
339 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 
381 aa  187  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  34.7 
 
 
598 aa  186  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 
373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
369 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
385 aa  180  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  30.79 
 
 
375 aa  177  3e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  29.22 
 
 
376 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  28.31 
 
 
370 aa  172  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
375 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  29.22 
 
 
376 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
383 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
374 aa  169  8e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
396 aa  169  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  34.7 
 
 
384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 
382 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  28.42 
 
 
376 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  34.95 
 
 
390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  27.08 
 
 
377 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.75 
 
 
377 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
399 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
382 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  26.56 
 
 
377 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
375 aa  158  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 
387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  29.16 
 
 
398 aa  146  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
381 aa  146  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
379 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
379 aa  136  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
403 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
408 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  24.92 
 
 
383 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
394 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 
362 aa  100  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 
348 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
377 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
391 aa  94  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
387 aa  93.2  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1971  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
407 aa  93.2  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.341888 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 
363 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  20.98 
 
 
384 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.85 
 
 
411 aa  90.5  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
377 aa  90.5  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  23.93 
 
 
381 aa  89.7  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>