More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1522 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  100 
 
 
371 aa  758    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  46.36 
 
 
371 aa  331  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  44.89 
 
 
374 aa  316  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  43.67 
 
 
598 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  43.82 
 
 
384 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  42.47 
 
 
404 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  39.78 
 
 
408 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  40.37 
 
 
382 aa  292  7e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  41.94 
 
 
373 aa  286  5e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  40.81 
 
 
381 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  39.84 
 
 
373 aa  276  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  42.74 
 
 
372 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  38.67 
 
 
383 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  38.62 
 
 
375 aa  256  4e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  39.46 
 
 
379 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  38.92 
 
 
381 aa  250  3e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  39.01 
 
 
378 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  39.01 
 
 
378 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.57 
 
 
378 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.57 
 
 
378 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.57 
 
 
385 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.57 
 
 
385 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.57 
 
 
385 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.57 
 
 
385 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.57 
 
 
385 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  38.74 
 
 
378 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.29 
 
 
378 aa  239  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  38.16 
 
 
381 aa  236  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
378 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
382 aa  233  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  37.07 
 
 
374 aa  232  7.000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  38.19 
 
 
378 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
378 aa  228  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  38.19 
 
 
378 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 
369 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  37.57 
 
 
382 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  37.67 
 
 
382 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  36.13 
 
 
387 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  37.91 
 
 
396 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  37.38 
 
 
377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.42 
 
 
377 aa  216  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.38 
 
 
380 aa  216  4e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  36.96 
 
 
388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  36.91 
 
 
390 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  35.8 
 
 
371 aa  210  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  37.81 
 
 
376 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  36.18 
 
 
379 aa  203  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  33.43 
 
 
382 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 
387 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.5 
 
 
377 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  34.92 
 
 
381 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
362 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 
390 aa  189  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
394 aa  180  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  34.5 
 
 
385 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.95 
 
 
341 aa  172  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
386 aa  169  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  29.17 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  37.19 
 
 
379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  34.43 
 
 
374 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  30.16 
 
 
371 aa  151  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  27.72 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  38.68 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
375 aa  145  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  30.52 
 
 
371 aa  144  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  25.77 
 
 
370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
390 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.41 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  45.07 
 
 
148 aa  135  9e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  25.82 
 
 
377 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  25.82 
 
 
377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 
385 aa  129  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  25.48 
 
 
376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  25.27 
 
 
376 aa  117  5e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  25 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 
387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  28.61 
 
 
375 aa  114  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
382 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
389 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
398 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
403 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
387 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  27.01 
 
 
383 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
362 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
377 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 
379 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 
379 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1182  putative glycosyl transferase  56.41 
 
 
79 aa  98.6  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.202119  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
381 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
377 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
379 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 
398 aa  90.5  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
395 aa  89.7  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  26.97 
 
 
406 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  26.97 
 
 
406 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 
379 aa  89  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
386 aa  87  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
408 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>