More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5046 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 379 aa  721    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  85.22 
 
 		 379 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  74.21 
 
 		 385 aa  500  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  75.66 
 
 		 389 aa  494  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  76.13 
 
 		 382 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  74.45 
 
 		 387 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  39.89 
 
 		 394 aa  269  8e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  41.35 
 
 		 379 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  41.33 
 
 		 386 aa  222  7e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  40.11 
 
 		 376 aa  219  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  45.22 
 
 		 341 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  40.32 
 
 		 387 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.88 
 
 		 380 aa  212  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  36.07 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  42.35 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  38.51 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.1 
 
 		 377 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  33.69 
 
 		 388 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 		 387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  34.42 
 
 		 385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.02 
 
 		 377 aa  172  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 		 371 aa  169  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.97 
 
 		 377 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  36.51 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  35.97 
 
 		 378 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  34.77 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  35.97 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  35.97 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  32.58 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.74 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.74 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.74 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.74 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.74 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.74 
 
 		 378 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.74 
 
 		 378 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  36.34 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  36.41 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  32.53 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  35.97 
 
 		 378 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 382 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 		 390 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 		 381 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.08 
 
 		 378 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 		 375 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  26.39 
 
 		 377 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  32.26 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  26.39 
 
 		 377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  33.82 
 
 		 598 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  36.76 
 
 		 384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  39.42 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 		 408 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  35.14 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 383 aa  123  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  32.7 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  25.47 
 
 		 378 aa  120  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  30.05 
 
 		 371 aa  119  7e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  27.62 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  26.05 
 
 		 375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  24.73 
 
 		 376 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  24.73 
 
 		 376 aa  110  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 		 390 aa  106  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  24.44 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  23.37 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  24.04 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  37.44 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  37.95 
 
 		 505 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  33.03 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  18.66 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.24 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  32.33 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  30.95 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  35.44 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 		 672 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  33.68 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  37.42 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  38.71 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  39.47 
 
 		 425 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  37.13 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>