More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1550 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 379 aa  756    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  48 
 
 		 382 aa  336  5e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  45.87 
 
 		 377 aa  333  3e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  45.72 
 
 		 380 aa  332  9e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  44.15 
 
 		 394 aa  318  7e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  46.93 
 
 		 387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.55 
 
 		 341 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  44.92 
 
 		 386 aa  301  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  44.35 
 
 		 376 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  43.68 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  38.06 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  42.32 
 
 		 374 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  39.78 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.17 
 
 		 377 aa  250  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.36 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  37.3 
 
 		 371 aa  235  9e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  35.56 
 
 		 385 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.3 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  39.35 
 
 		 385 aa  206  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  40 
 
 		 389 aa  199  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  41.72 
 
 		 387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  40 
 
 		 382 aa  196  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  31.75 
 
 		 377 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  31.22 
 
 		 377 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  36.14 
 
 		 382 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  36.07 
 
 		 382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  46.19 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  34.79 
 
 		 378 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 		 373 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 404 aa  185  9e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  41.35 
 
 		 379 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  34.31 
 
 		 378 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  36.7 
 
 		 371 aa  176  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  38.9 
 
 		 379 aa  175  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  34.86 
 
 		 381 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.92 
 
 		 378 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.66 
 
 		 385 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.66 
 
 		 385 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.66 
 
 		 385 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.66 
 
 		 385 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.66 
 
 		 385 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.66 
 
 		 378 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.66 
 
 		 378 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  36.36 
 
 		 371 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 		 373 aa  168  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 		 408 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  29.97 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  34.26 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 		 374 aa  163  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  31 
 
 		 382 aa  159  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 		 369 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  30.08 
 
 		 378 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  27.73 
 
 		 371 aa  157  3e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 		 372 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 		 375 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  34.07 
 
 		 374 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  34.7 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 		 390 aa  146  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  29.43 
 
 		 370 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 		 396 aa  139  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 399 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  29.2 
 
 		 598 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  27.66 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  27.47 
 
 		 375 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  27.45 
 
 		 376 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  27.45 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  26.89 
 
 		 376 aa  125  9e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 		 381 aa  123  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 362 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 379 aa  97.8  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  35.21 
 
 		 148 aa  97.4  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 		 387 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 		 391 aa  95.9  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 		 401 aa  94.7  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 		 377 aa  94.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0268  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 		 360 aa  93.6  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 		 408 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 377 aa  89.4  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.12 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>