More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1545 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
339 aa  676    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  53.88 
 
 
388 aa  259  6e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  52.4 
 
 
387 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  54.67 
 
 
376 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.8 
 
 
377 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  44.05 
 
 
371 aa  205  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.29 
 
 
377 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  40.66 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.66 
 
 
380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  41.42 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.56 
 
 
341 aa  195  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  43.62 
 
 
382 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  46.19 
 
 
379 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  46.35 
 
 
396 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  47.11 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  40.93 
 
 
387 aa  176  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  42.08 
 
 
385 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  47.03 
 
 
374 aa  173  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  44.74 
 
 
404 aa  172  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  44.54 
 
 
382 aa  166  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  43.83 
 
 
382 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  84.16 
 
 
319 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  41.18 
 
 
408 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  41.74 
 
 
390 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  39.74 
 
 
381 aa  152  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  44.59 
 
 
372 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  43.23 
 
 
378 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  40.5 
 
 
379 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.72 
 
 
385 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  36.64 
 
 
373 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  42.68 
 
 
378 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.72 
 
 
378 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.72 
 
 
378 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  42.29 
 
 
378 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  43.23 
 
 
378 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  43.23 
 
 
378 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.72 
 
 
385 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.72 
 
 
385 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.72 
 
 
385 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.72 
 
 
385 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  38.68 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  43.23 
 
 
378 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.29 
 
 
378 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  40.25 
 
 
381 aa  146  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  39.56 
 
 
373 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  43.23 
 
 
378 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  40.62 
 
 
382 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  43.46 
 
 
384 aa  143  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  39.63 
 
 
374 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 
375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  34.11 
 
 
374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  35.16 
 
 
382 aa  135  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  35.35 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 
379 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  30.86 
 
 
378 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
362 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 
396 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  29.72 
 
 
377 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  29.32 
 
 
377 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.71 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  37.44 
 
 
371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  29.07 
 
 
371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
399 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  41.08 
 
 
387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  37.67 
 
 
598 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.14 
 
 
322 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  38.74 
 
 
385 aa  113  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  40.21 
 
 
382 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  27.37 
 
 
371 aa  110  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  39.68 
 
 
389 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  29.87 
 
 
371 aa  106  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  27.82 
 
 
376 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  40.54 
 
 
379 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  30.59 
 
 
376 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  35.56 
 
 
148 aa  104  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
390 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
360 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  35.87 
 
 
381 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  27.53 
 
 
376 aa  102  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
398 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
390 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
319 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.86 
 
 
320 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  27.85 
 
 
375 aa  99.8  6e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 
378 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  53.27 
 
 
323 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.48 
 
 
321 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 
386 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
379 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  32.94 
 
 
763 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 
387 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  37.16 
 
 
398 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
396 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 
391 aa  92  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  36.87 
 
 
391 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.51 
 
 
315 aa  89.7  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>