More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1603 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
382 aa  788    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  58.29 
 
 
375 aa  457  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  57.37 
 
 
374 aa  450  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  56.8 
 
 
381 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  39.52 
 
 
381 aa  288  1e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  38.95 
 
 
384 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  36.8 
 
 
383 aa  257  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 
404 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  38.13 
 
 
374 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  38.26 
 
 
598 aa  239  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 
408 aa  236  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  36 
 
 
371 aa  233  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
382 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 
379 aa  229  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
373 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 
381 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  35.37 
 
 
372 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
373 aa  216  5e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  34.84 
 
 
371 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  36.55 
 
 
382 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  34.8 
 
 
382 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.24 
 
 
378 aa  187  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
378 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
378 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  34.14 
 
 
378 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
385 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
385 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
385 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
385 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
385 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 
378 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 
378 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.12 
 
 
380 aa  179  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  33.12 
 
 
377 aa  179  7e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 
378 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 
378 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 
378 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 
388 aa  176  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
369 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
390 aa  169  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.55 
 
 
377 aa  169  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.71 
 
 
341 aa  162  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
394 aa  161  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
396 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
386 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 
385 aa  159  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 
376 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 
381 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
387 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 
379 aa  157  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  30.47 
 
 
371 aa  155  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.23 
 
 
377 aa  155  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 
379 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  48.28 
 
 
148 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
371 aa  149  9e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
375 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  28.45 
 
 
378 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  28.22 
 
 
371 aa  144  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
362 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  26.72 
 
 
370 aa  139  7e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  27.69 
 
 
376 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  35.16 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  27.69 
 
 
376 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  32.36 
 
 
374 aa  133  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  27.18 
 
 
376 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  25.62 
 
 
371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.7 
 
 
377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  26.4 
 
 
375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
396 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  26.17 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  26.17 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  26.02 
 
 
383 aa  105  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
398 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
385 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
389 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 
362 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 
390 aa  93.2  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4950  glycosyl transferase  29.52 
 
 
360 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00550219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 
403 aa  91.3  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
379 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 
408 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
387 aa  87  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.13 
 
 
356 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 
364 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 
381 aa  84  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
379 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  28.21 
 
 
369 aa  80.1  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
404 aa  79.3  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
364 aa  79.3  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 
377 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>