More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5040 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 362 aa  717    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 		 373 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  30.97 
 
 		 381 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  24.27 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  31.17 
 
 		 382 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  29.94 
 
 		 371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.82 
 
 		 378 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.82 
 
 		 378 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  32.25 
 
 		 378 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.82 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.82 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.82 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.82 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.82 
 
 		 385 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 		 374 aa  107  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 		 378 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 382 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 		 382 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.56 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 378 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 		 385 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 		 381 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  26.48 
 
 		 377 aa  103  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.48 
 
 		 380 aa  103  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 378 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 378 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  28.14 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  30.88 
 
 		 598 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.59 
 
 		 341 aa  99  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 		 386 aa  97.4  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 		 379 aa  96.7  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 381 aa  94.4  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  29.17 
 
 		 374 aa  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 		 371 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.32 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  33.33 
 
 		 428 aa  87.4  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 339 aa  86.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  25.43 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  25.43 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  24.05 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.41 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  36.98 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  23.46 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.13 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05930  glycosyltransferase  32.07 
 
 		 378 aa  75.9  0.0000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289999  hitchhiker  0.000000027455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  29.65 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  30.94 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  20.71 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  22.9 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  36.51 
 
 		 443 aa  69.7  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.3 
 
 		 435 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 904 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  23.45 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.33 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 		 772 aa  68.2  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  29.81 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  24.2 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2414  glycosyl transferase group 1 family protein  27.11 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  30.11 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  31.25 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.772955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>