More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2645 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 384 aa  769    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  50.67 
 
 		 374 aa  326  5e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  49.07 
 
 		 372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  43.28 
 
 		 383 aa  302  8.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  43.82 
 
 		 371 aa  301  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  46.91 
 
 		 598 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  45.04 
 
 		 408 aa  299  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  45.72 
 
 		 404 aa  299  6e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  45.01 
 
 		 371 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  44.09 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  41.22 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  37.6 
 
 		 381 aa  265  7e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  38.03 
 
 		 375 aa  265  8e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  43.34 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  36.41 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  41.95 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  38.95 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  44.27 
 
 		 373 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  41.55 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  41.67 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  41.21 
 
 		 378 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  40.44 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  41.47 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.63 
 
 		 378 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.63 
 
 		 378 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.63 
 
 		 385 aa  235  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.63 
 
 		 385 aa  235  8e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.63 
 
 		 385 aa  235  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.63 
 
 		 385 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.63 
 
 		 385 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  41.73 
 
 		 378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  40.22 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.63 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  40.42 
 
 		 378 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  40.42 
 
 		 378 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  39.9 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  39.9 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.24 
 
 		 380 aa  213  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  36.24 
 
 		 377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.15 
 
 		 377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  36.91 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  34.44 
 
 		 378 aa  194  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  37.97 
 
 		 382 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  40.79 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 		 390 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  37.7 
 
 		 387 aa  182  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 		 362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  37.16 
 
 		 381 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  39.04 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 369 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.55 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  34.01 
 
 		 388 aa  172  9e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  34.7 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  32.01 
 
 		 371 aa  166  9e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 		 394 aa  164  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  33.52 
 
 		 371 aa  162  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  30.38 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.84 
 
 		 377 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  29.52 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 		 385 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  31.18 
 
 		 371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  34.7 
 
 		 379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 375 aa  145  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  29.66 
 
 		 376 aa  144  4e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  43.46 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  36.27 
 
 		 386 aa  143  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  30.63 
 
 		 376 aa  142  8e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  30.1 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  38.26 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  29.21 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  29.23 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  42.36 
 
 		 148 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 		 398 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 		 396 aa  116  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  24.57 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  24.29 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  35.4 
 
 		 382 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 		 389 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 		 413 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 377 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1182  putative glycosyl transferase  52.63 
 
 		 79 aa  88.2  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.202119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  35.75 
 
 		 358 aa  87.4  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 		 401 aa  86.3  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  42.27 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4950  glycosyl transferase  31.03 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00550219  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  38.37 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.68 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  32.25 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.647654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>