More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4590 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
375 aa  771    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 
386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
396 aa  172  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 
385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
404 aa  163  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
387 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
388 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
382 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  28.65 
 
 
371 aa  150  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  27.49 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.49 
 
 
377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
379 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  31.39 
 
 
371 aa  145  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
384 aa  145  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
376 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
394 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.8 
 
 
380 aa  142  7e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
371 aa  142  9e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  28.95 
 
 
377 aa  142  9e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.98 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 
378 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 
378 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.95 
 
 
378 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.95 
 
 
378 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.95 
 
 
378 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.95 
 
 
385 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.95 
 
 
385 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.95 
 
 
385 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.95 
 
 
385 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.95 
 
 
385 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 
378 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
378 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 
378 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  28.08 
 
 
376 aa  136  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
382 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.08 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  27.25 
 
 
376 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
378 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
372 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  26.76 
 
 
382 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  27.89 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  27.2 
 
 
378 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
375 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
381 aa  126  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
374 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 
379 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  24.4 
 
 
370 aa  124  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  26.08 
 
 
381 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
390 aa  124  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  31.91 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  25.4 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
374 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  26.67 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
381 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 
369 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  28.25 
 
 
598 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
382 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
399 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
373 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  24.07 
 
 
375 aa  103  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 
396 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
403 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
398 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  22.38 
 
 
377 aa  96.3  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4950  glycosyl transferase  37.3 
 
 
360 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00550219  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  22.1 
 
 
377 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
385 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
382 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  26.1 
 
 
383 aa  90.5  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
379 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
389 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  33.83 
 
 
148 aa  88.6  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 
379 aa  87.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.68 
 
 
356 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  22.48 
 
 
385 aa  87  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
360 aa  86.7  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
381 aa  86.7  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 
362 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
408 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  28.46 
 
 
426 aa  79.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>