More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0890 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  98.68 
 
 
378 aa  754    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  94.97 
 
 
378 aa  735    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  91.8 
 
 
378 aa  702    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  91.8 
 
 
378 aa  704    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
378 aa  762    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  92.06 
 
 
378 aa  704    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
378 aa  762    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  77.25 
 
 
378 aa  594  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  76.72 
 
 
385 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  76.72 
 
 
378 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  76.72 
 
 
378 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  76.72 
 
 
385 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  76.72 
 
 
385 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  76.72 
 
 
385 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  76.72 
 
 
385 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  69.84 
 
 
382 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  69.43 
 
 
390 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  69.58 
 
 
382 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  43.29 
 
 
381 aa  282  7.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  43.05 
 
 
408 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  42.42 
 
 
379 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  35.23 
 
 
378 aa  262  6e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  43.05 
 
 
373 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  41.6 
 
 
404 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  41.58 
 
 
382 aa  250  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
369 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  41.4 
 
 
374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.67 
 
 
380 aa  242  7e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  38.67 
 
 
377 aa  242  7.999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  39.01 
 
 
371 aa  242  7.999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  38.54 
 
 
371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  41.71 
 
 
598 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  41.64 
 
 
372 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  39.9 
 
 
384 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  36.91 
 
 
373 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
362 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  37.6 
 
 
381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  36.68 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  38.19 
 
 
381 aa  219  6e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 
379 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  37.6 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  37.57 
 
 
382 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  38.95 
 
 
387 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.27 
 
 
341 aa  209  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  38.87 
 
 
376 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
374 aa  206  7e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
383 aa  199  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 
375 aa  193  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 
371 aa  191  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  34.71 
 
 
388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  36.07 
 
 
386 aa  189  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.09 
 
 
377 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
381 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.22 
 
 
377 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  32.25 
 
 
394 aa  186  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 
390 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 
382 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 
379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  31.89 
 
 
371 aa  168  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 
385 aa  165  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  30.91 
 
 
371 aa  161  2e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  32.97 
 
 
371 aa  160  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  27.85 
 
 
375 aa  160  5e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  27.51 
 
 
376 aa  159  7e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  39.2 
 
 
374 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  27.51 
 
 
376 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  26.72 
 
 
376 aa  155  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  43.23 
 
 
339 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 
396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
399 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
375 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  26.68 
 
 
370 aa  139  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.52 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  26.87 
 
 
377 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  26.87 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  31.99 
 
 
398 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
403 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  26.25 
 
 
383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 
387 aa  109  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
408 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
387 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 
381 aa  105  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
389 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
379 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1349  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
394 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 
362 aa  97.1  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
414 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  35.49 
 
 
379 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 
379 aa  93.2  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 
413 aa  92.8  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 
379 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 
385 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
415 aa  89.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.72 
 
 
419 aa  89.7  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
404 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  22.72 
 
 
384 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
386 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  34.31 
 
 
148 aa  87.4  4e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>