More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3174 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
377 aa  769    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  47.99 
 
 
376 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  47.57 
 
 
388 aa  355  8.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  48.5 
 
 
371 aa  350  2e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.92 
 
 
377 aa  333  4e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  41.89 
 
 
387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  45.16 
 
 
382 aa  325  9e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  41.18 
 
 
377 aa  313  2.9999999999999996e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.24 
 
 
380 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  36.39 
 
 
386 aa  277  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  35.39 
 
 
394 aa  271  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.53 
 
 
341 aa  262  6e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  34.56 
 
 
396 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 
387 aa  249  6e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  37.54 
 
 
385 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
379 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  38.46 
 
 
374 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  36.46 
 
 
372 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  37.76 
 
 
408 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 
404 aa  227  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  36.52 
 
 
382 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  37.42 
 
 
371 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  35.68 
 
 
374 aa  216  7e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  36.93 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  35.69 
 
 
373 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
379 aa  206  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
379 aa  206  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  31.88 
 
 
382 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  43.29 
 
 
339 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  36.04 
 
 
383 aa  203  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  35.02 
 
 
381 aa  203  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.23 
 
 
385 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.23 
 
 
378 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.23 
 
 
385 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.23 
 
 
378 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 
384 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  31 
 
 
377 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.23 
 
 
385 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.23 
 
 
385 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.23 
 
 
385 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
382 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.96 
 
 
378 aa  201  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  30.46 
 
 
377 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  32.6 
 
 
378 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
378 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 
378 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
381 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 
378 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.02 
 
 
377 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
378 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  33.12 
 
 
371 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 
378 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 
378 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  33.61 
 
 
598 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 
369 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  29.73 
 
 
371 aa  177  3e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
385 aa  166  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  28.21 
 
 
378 aa  166  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  30.18 
 
 
376 aa  166  5e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  29.92 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  29.92 
 
 
376 aa  162  7e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 
374 aa  160  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
389 aa  160  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
382 aa  159  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
387 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
382 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
390 aa  153  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 
375 aa  153  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  28.92 
 
 
371 aa  150  5e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
379 aa  149  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  30.3 
 
 
375 aa  149  9e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  28.46 
 
 
371 aa  146  7.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  26.19 
 
 
370 aa  142  8e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
396 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
391 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 
387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 
378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
398 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  38.97 
 
 
148 aa  101  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  26.98 
 
 
383 aa  101  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
389 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
379 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
377 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  23.79 
 
 
362 aa  86.7  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
409 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  22.07 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1919  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>