More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1663 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
379 aa  781    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  47.47 
 
 
383 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  44.32 
 
 
373 aa  333  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  40.86 
 
 
408 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  41.22 
 
 
384 aa  297  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  38.3 
 
 
598 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  43.13 
 
 
372 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  38.01 
 
 
404 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  39.47 
 
 
374 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  36.83 
 
 
373 aa  262  8e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  39.46 
 
 
371 aa  260  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 
382 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  36.1 
 
 
374 aa  255  9e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  36.59 
 
 
371 aa  247  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  34.32 
 
 
381 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 
382 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  34.93 
 
 
375 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 
381 aa  237  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  36.07 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 
378 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  35.26 
 
 
378 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 
382 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  34.99 
 
 
378 aa  229  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 
378 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 
390 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 
378 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  34.16 
 
 
378 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  34.16 
 
 
378 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  34.46 
 
 
378 aa  224  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.63 
 
 
380 aa  222  9e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  34.63 
 
 
377 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  35.34 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.7 
 
 
385 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.7 
 
 
378 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.7 
 
 
378 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.7 
 
 
385 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.7 
 
 
385 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.7 
 
 
385 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.7 
 
 
385 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.43 
 
 
378 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.03 
 
 
377 aa  209  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 
381 aa  207  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
396 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
369 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  34.6 
 
 
376 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
387 aa  202  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.02 
 
 
341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
362 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
382 aa  189  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
387 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
388 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 
394 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.08 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  28.66 
 
 
386 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  32.21 
 
 
371 aa  162  6e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  29.92 
 
 
371 aa  153  4e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
390 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
374 aa  150  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  28.22 
 
 
375 aa  147  3e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 
379 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  27.71 
 
 
376 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  27.58 
 
 
376 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  28.17 
 
 
371 aa  139  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  27.14 
 
 
376 aa  138  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 
339 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
375 aa  132  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  25.81 
 
 
370 aa  130  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  27.87 
 
 
371 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.99 
 
 
377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 
396 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  26.53 
 
 
377 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
382 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  26.24 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  23.45 
 
 
398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  24.21 
 
 
383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
390 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
385 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
387 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  23.12 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  36.88 
 
 
148 aa  94.7  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 
381 aa  93.6  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 
403 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
379 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  23.86 
 
 
394 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
409 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
379 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
379 aa  90.1  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.05 
 
 
356 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  24.11 
 
 
387 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  24.4 
 
 
369 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  29.12 
 
 
346 aa  87  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4950  glycosyl transferase  29.89 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00550219  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 
426 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>