More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2649 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 381 aa  780    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  45.81 
 
 		 403 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  42.74 
 
 		 383 aa  280  3e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 		 408 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 379 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 		 396 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3483  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 		 385 aa  133  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0885784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 		 399 aa  130  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 		 404 aa  112  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1971  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.341888 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  23.53 
 
 		 382 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 		 378 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 		 378 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.17 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  27.41 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  21.89 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  22.95 
 
 		 378 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  28.17 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  22.94 
 
 		 382 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.19 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.19 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.19 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.19 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.26 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.19 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.19 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.19 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  23.23 
 
 		 378 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 		 387 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 371 aa  99.8  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  23.23 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 		 384 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 		 387 aa  97.8  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 373 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  26.85 
 
 		 376 aa  89.7  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 		 396 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.92 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  27.49 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  26.54 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  31.58 
 
 		 370 aa  87  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 		 375 aa  86.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 		 385 aa  86.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  26.93 
 
 		 371 aa  86.3  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0121  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1919  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  26.95 
 
 		 598 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0487  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000304875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  26.38 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  25.81 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.55 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  25 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  28.34 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  25.62 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  26.35 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  23.05 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  29.33 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  23.78 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2956  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.03 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3376  glycosyl transferase, group 1  23.58 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666648  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  24.64 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  27.4 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.1 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 		 383 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>