More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13003 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  100 
 
 
383 aa  781    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  38.95 
 
 
403 aa  289  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  42.74 
 
 
381 aa  280  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
408 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
379 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 
396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
399 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
398 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  35.78 
 
 
390 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3483  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 
385 aa  162  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0885784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1971  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
407 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.341888 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
382 aa  153  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
404 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  29.97 
 
 
384 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
381 aa  137  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  28.85 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  29.57 
 
 
374 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
384 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
387 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
381 aa  127  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
373 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 
387 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
372 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
398 aa  122  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
382 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  24.85 
 
 
378 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  25.37 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
378 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 
374 aa  117  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
379 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 
375 aa  113  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  28 
 
 
370 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  27.01 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.01 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
384 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.84 
 
 
378 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.61 
 
 
385 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.58 
 
 
379 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.61 
 
 
385 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.61 
 
 
385 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.61 
 
 
385 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.61 
 
 
385 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.61 
 
 
378 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.61 
 
 
378 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
386 aa  109  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
371 aa  108  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  26.24 
 
 
369 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
385 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
387 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 
368 aa  106  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
382 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  27.01 
 
 
371 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  23.37 
 
 
394 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
377 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
392 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  27.09 
 
 
598 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 
385 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
373 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
385 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1919  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 
407 aa  102  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854337 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 
386 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  27.95 
 
 
371 aa  102  9e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
366 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
373 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.98 
 
 
377 aa  101  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
390 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 
379 aa  99.8  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  26.53 
 
 
371 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 
403 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.11 
 
 
373 aa  97.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.24 
 
 
373 aa  97.1  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  26.33 
 
 
371 aa  96.7  6e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 
382 aa  96.7  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 
386 aa  96.7  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 
376 aa  96.3  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
398 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5390  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 
384 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  27.94 
 
 
368 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 
388 aa  94.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>