More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0781 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  100 
 
 
377 aa  768    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  99.47 
 
 
377 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  69.87 
 
 
377 aa  578  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  33.87 
 
 
377 aa  237  3e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.87 
 
 
380 aa  236  3e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
387 aa  205  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  31 
 
 
377 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 
382 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 
371 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.33 
 
 
377 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 
379 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
394 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
376 aa  179  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
385 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
396 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  26.08 
 
 
386 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.22 
 
 
341 aa  159  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 
374 aa  157  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
387 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
389 aa  142  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
382 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  26.14 
 
 
382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
382 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
408 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
385 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  25.82 
 
 
371 aa  132  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 
378 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 
378 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
378 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.26 
 
 
378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.26 
 
 
378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 
378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.26 
 
 
385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.26 
 
 
385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.26 
 
 
385 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.26 
 
 
385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.26 
 
 
385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  27.32 
 
 
371 aa  125  8.000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.6 
 
 
378 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  28.42 
 
 
378 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
373 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
339 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  26.61 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  29.15 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  29.06 
 
 
371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  27.98 
 
 
376 aa  119  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  28.82 
 
 
376 aa  119  9e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
378 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  28.46 
 
 
375 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 
375 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
379 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0845  galactosyltransferase  98.25 
 
 
57 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000764871 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  27.02 
 
 
370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  24.78 
 
 
374 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  23.85 
 
 
390 aa  110  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
372 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 
384 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
374 aa  107  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 
381 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
381 aa  105  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
390 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
399 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  26.13 
 
 
371 aa  100  6e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
381 aa  100  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  24.93 
 
 
598 aa  99.4  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
396 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
379 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  22.38 
 
 
375 aa  96.3  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  27.78 
 
 
388 aa  90.5  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
411 aa  86.7  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  25.16 
 
 
383 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.86 
 
 
407 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  29.68 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
422 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
422 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
373 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  31.88 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
406 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1410  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.64 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>