More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1973 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 389 aa  753    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  98.16 
 
 		 382 aa  721    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  91.69 
 
 		 385 aa  642    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  77.9 
 
 		 387 aa  501  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  75.4 
 
 		 379 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5046  glycosyl transferase group 1  75.66 
 
 		 379 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  39.14 
 
 		 394 aa  256  4e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  40.53 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.99 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  39.3 
 
 		 379 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  37.17 
 
 		 376 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  38.4 
 
 		 387 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  35.19 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.19 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  36.87 
 
 		 385 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 		 396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  40.6 
 
 		 374 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 		 387 aa  192  9e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.75 
 
 		 377 aa  190  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 		 388 aa  189  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.08 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  29.81 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  29.81 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.53 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  31.63 
 
 		 371 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 		 373 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  33.98 
 
 		 381 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 		 408 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  34.39 
 
 		 598 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  38.84 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  35.53 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  34.3 
 
 		 372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 		 375 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  31.43 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  31.99 
 
 		 378 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.6 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 		 381 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.6 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.6 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.6 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.6 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.6 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.6 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 		 378 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 		 378 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  32.07 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  27 
 
 		 371 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 		 378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.87 
 
 		 378 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 		 383 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 		 378 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  35.11 
 
 		 384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  25.07 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  28.42 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  25.33 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  33.66 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  25.4 
 
 		 376 aa  110  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 		 390 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  27.02 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  26.49 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  25.41 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  24.85 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  21.02 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 399 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.33 
 
 		 409 aa  88.2  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  25.75 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  40.86 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  36.82 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  34.42 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  32.17 
 
 		 148 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0791  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.82 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  35.03 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  40.68 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>