More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1001 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 411 aa  854    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  76.35 
 
 		 406 aa  656    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  68.66 
 
 		 406 aa  587  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  67.17 
 
 		 407 aa  570  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.07 
 
 		 409 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  38.93 
 
 		 414 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  38.23 
 
 		 409 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 		 407 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.42 
 
 		 400 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  37.47 
 
 		 408 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  34.84 
 
 		 405 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 		 400 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  34.42 
 
 		 440 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  33.25 
 
 		 420 aa  203  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  33.25 
 
 		 420 aa  203  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 		 404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 426 aa  193  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 		 401 aa  189  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 		 430 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 		 415 aa  186  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 410 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 		 417 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3184  glycosyl transferase, group 1  33.05 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.845721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 422 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 		 422 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 		 416 aa  161  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  31.72 
 
 		 403 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 		 454 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  30.52 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 		 417 aa  149  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  31.73 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 		 437 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 409 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 		 452 aa  141  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 		 407 aa  141  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  31.86 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 		 417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 		 426 aa  130  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  33.98 
 
 		 401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 		 415 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  27.83 
 
 		 411 aa  126  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  29.71 
 
 		 414 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  28.57 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  28.57 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 415 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  41.25 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 		 358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 395 aa  113  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 		 373 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 		 355 aa  113  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  33.22 
 
 		 406 aa  112  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 		 369 aa  112  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.07 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  27.36 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  27.29 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  27.84 
 
 		 406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.52 
 
 		 406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  37.89 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.76 
 
 		 406 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.52 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 		 360 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  27.84 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  34.02 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  25.66 
 
 		 654 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.76 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  38.42 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 455 aa  106  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.21 
 
 		 406 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  33.05 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.02 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  35.89 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  38.96 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 412 aa  103  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 		 412 aa  103  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  35.88 
 
 		 350 aa  103  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 		 373 aa  102  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  36.32 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  27.61 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  23.73 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>