More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1396 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
440 aa  892    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  45.3 
 
 
413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
377 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.91 
 
 
419 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  35.63 
 
 
399 aa  127  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
372 aa  126  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
387 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  36.11 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  37.18 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  36.33 
 
 
384 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  34.33 
 
 
398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.21 
 
 
366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
369 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  36.74 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 
398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 
384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
385 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  28.42 
 
 
370 aa  110  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
378 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  36.57 
 
 
439 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
377 aa  108  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
361 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
412 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2857  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 
379 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  37.74 
 
 
402 aa  106  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  34.69 
 
 
373 aa  106  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
364 aa  106  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
371 aa  106  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.67 
 
 
407 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
394 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
381 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
393 aa  106  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
374 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 
411 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
377 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
403 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
371 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 
387 aa  104  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 
370 aa  103  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
389 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.19 
 
 
365 aa  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  34.98 
 
 
392 aa  103  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2765  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
379 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117052  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
385 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
412 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
381 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
359 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.43 
 
 
365 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
374 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2949  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
379 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244554  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 
383 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  27.31 
 
 
371 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  27.02 
 
 
401 aa  100  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
374 aa  100  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 
348 aa  100  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
539 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 
373 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  29.05 
 
 
745 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  38.69 
 
 
351 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 
395 aa  98.2  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
360 aa  98.2  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
368 aa  97.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
1079 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
367 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 
412 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
362 aa  97.1  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
385 aa  97.1  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.23 
 
 
411 aa  96.3  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 
366 aa  96.3  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
378 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
364 aa  95.9  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 
446 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 
414 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
409 aa  95.1  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  29.36 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
378 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2639  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 
380 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0320  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
373 aa  94.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527703  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.32 
 
 
360 aa  94.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  33.07 
 
 
388 aa  94.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  35.07 
 
 
388 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
1080 aa  94.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
391 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  35.27 
 
 
415 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
392 aa  94.4  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  31.99 
 
 
371 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
355 aa  94  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 
377 aa  94  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>