More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0320 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0320  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
373 aa  750    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527703  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0185  glycosyl transferase, group 1  69.59 
 
 
385 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.634207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0268  glycosyl transferase, group 1  67.22 
 
 
387 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  51.96 
 
 
377 aa  347  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 
399 aa  124  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 
382 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
374 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 
439 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
370 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 
394 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
440 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13811  hypothetical protein  22.91 
 
 
374 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  25.67 
 
 
369 aa  104  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 
371 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1210  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 
373 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.76 
 
 
366 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
377 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
379 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.76 
 
 
365 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
360 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
369 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
383 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  36.91 
 
 
389 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
366 aa  99.8  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
370 aa  99.4  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
386 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  32.16 
 
 
398 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0405  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
351 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
1080 aa  97.1  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 
387 aa  97.1  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
385 aa  96.7  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  35.35 
 
 
440 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
383 aa  96.3  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  23.54 
 
 
745 aa  95.9  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
381 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 
398 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
412 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
393 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
388 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  35.9 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
364 aa  94  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  33.03 
 
 
398 aa  93.6  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.79 
 
 
388 aa  93.6  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
384 aa  93.6  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
407 aa  93.2  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  25.14 
 
 
745 aa  93.6  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1919  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
407 aa  93.2  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854337 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
366 aa  93.2  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 
371 aa  92.8  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 
412 aa  92.8  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
413 aa  92.8  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
904 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  37.29 
 
 
387 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
374 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 
350 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 
353 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
383 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
371 aa  90.9  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.97 
 
 
419 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  29.61 
 
 
372 aa  90.1  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 
739 aa  89.7  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
367 aa  89.7  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.92 
 
 
360 aa  89.4  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.67 
 
 
415 aa  89.4  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  27.87 
 
 
384 aa  89.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
374 aa  89  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 
383 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
369 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  26.16 
 
 
371 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  31.01 
 
 
398 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 
750 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
369 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
370 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5246  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
704 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  25.7 
 
 
399 aa  87.8  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4566  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
371 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.416296  normal  0.520192 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
386 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  21.9 
 
 
384 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
387 aa  87.8  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
388 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
371 aa  87  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4413  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 
394 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 
446 aa  87.4  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
371 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 
387 aa  87.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 
410 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
388 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
390 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 
371 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1422  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
383 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>