More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3643 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
387 aa  780    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0495  glycosyl transferase group 1  80 
 
 
387 aa  590  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4413  glycosyl transferase group 1  45.29 
 
 
394 aa  302  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  36.75 
 
 
391 aa  229  7e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  35.51 
 
 
378 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
385 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5390  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
384 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
398 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1432  glycosyltransferase  29.05 
 
 
386 aa  150  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 
379 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  29.47 
 
 
369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
399 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
390 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
396 aa  126  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  26.09 
 
 
384 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  32.13 
 
 
401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
378 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 
385 aa  113  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 
389 aa  113  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
381 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 
439 aa  112  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.86 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.86 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  36.02 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
398 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  26 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.06 
 
 
381 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  26.06 
 
 
381 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  26.06 
 
 
381 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.06 
 
 
381 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  26.06 
 
 
381 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
371 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.78 
 
 
381 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
386 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
381 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
378 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
371 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
415 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2213  glycosyl transferase group 1  38.54 
 
 
384 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.013573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
390 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  35.07 
 
 
370 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  30.55 
 
 
371 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
381 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  23.68 
 
 
371 aa  105  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
390 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
367 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
387 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
383 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  22.28 
 
 
377 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  34.35 
 
 
380 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 
393 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  32.6 
 
 
383 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
388 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  36.32 
 
 
419 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  23.33 
 
 
378 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
388 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1755  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
365 aa  102  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
367 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
375 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 
387 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
421 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
396 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 
419 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
377 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
413 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
384 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
361 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
398 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 
391 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1641  glycosyl transferase, group 1  37.3 
 
 
390 aa  100  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1210  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 
373 aa  100  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
376 aa  100  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.96 
 
 
371 aa  99.8  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
384 aa  99.8  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 
357 aa  99.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  23.95 
 
 
371 aa  99  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 
374 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
370 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  35.43 
 
 
383 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
371 aa  97.4  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
382 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
378 aa  96.3  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  28.66 
 
 
381 aa  96.3  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  32.44 
 
 
379 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
380 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
381 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  35.79 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
380 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1461  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
362 aa  95.5  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 
401 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  22.85 
 
 
371 aa  95.5  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>