More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2253 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
371 aa  741    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  36.9 
 
 
371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  35.26 
 
 
371 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 
361 aa  179  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2836  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 
381 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0535409  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0723  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
374 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0812  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol  29.59 
 
 
381 aa  140  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
368 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.03 
 
 
349 aa  125  9e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
367 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.41 
 
 
365 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 
364 aa  123  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  28.98 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.83 
 
 
366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1904  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 
380 aa  119  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0474  phosphatidylserine decarboxylase proenzyme  25.74 
 
 
357 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1970  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.27 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.622301  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
376 aa  116  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4386  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  33.23 
 
 
386 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  23.21 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1232  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.63 
 
 
357 aa  110  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
363 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 
383 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  32.87 
 
 
380 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  35.63 
 
 
399 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.19 
 
 
419 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
387 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  39.23 
 
 
935 aa  107  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
364 aa  106  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
419 aa  106  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
391 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  34.82 
 
 
414 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
387 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 
401 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
419 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  31.96 
 
 
370 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
385 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 
374 aa  104  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
371 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4267  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
406 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 
381 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
419 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 
403 aa  103  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 
360 aa  103  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  23.12 
 
 
394 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
390 aa  103  7e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  39.41 
 
 
433 aa  102  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  27.99 
 
 
408 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 
375 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  35.74 
 
 
417 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
398 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
410 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 
384 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 
395 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 
396 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 
387 aa  100  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
391 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2384  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
374 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 
401 aa  100  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1350  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
406 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
378 aa  99.8  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 
382 aa  99.8  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0061  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.79 
 
 
362 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
394 aa  99.4  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4266  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
395 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 
391 aa  99.4  8e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.89 
 
 
396 aa  99.4  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
398 aa  99.4  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0045  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.49 
 
 
362 aa  99  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
384 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
423 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  34.18 
 
 
378 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  33.23 
 
 
408 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4854  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  26.49 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  33.2 
 
 
376 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0261  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  27 
 
 
362 aa  97.8  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
379 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
374 aa  97.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
374 aa  97.1  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
382 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  40.11 
 
 
389 aa  97.1  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
399 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 
446 aa  96.7  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  35.56 
 
 
365 aa  96.7  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  36.96 
 
 
387 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 
364 aa  96.3  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  38.96 
 
 
353 aa  96.3  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
390 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
381 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
402 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>