More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0261 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009786  EcE24377A_F0045  glycosyl transferase, group 1 family protein  95.3 
 
 		 362 aa  728    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0061  glycosyl transferase, group 1 family protein  95.86 
 
 		 362 aa  730    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4854  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  95.3 
 
 		 362 aa  726    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0261  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 362 aa  755    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  59.28 
 
 		 367 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4386  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 		 361 aa  136  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  24.51 
 
 		 371 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  23.23 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  23.16 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  27 
 
 		 371 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 		 368 aa  97.1  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 		 377 aa  94  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  22.8 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 		 374 aa  90.9  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 383 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.47 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0812  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol  20.96 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  31.84 
 
 		 420 aa  87  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 395 aa  86.3  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 		 382 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0723  glycosyl transferase group 1  20.96 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  30.49 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  23.01 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  23.18 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  24.49 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  24.87 
 
 		 769 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  28.81 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  23.51 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.06 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.04 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  30.23 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 		 430 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  29.71 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  37.98 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1076  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1904  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1970  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.622301  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 		 482 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  27.52 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  22.19 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  31.72 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  29.95 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  21.23 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.49 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0292  glycosyltransferase  23.51 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000491136  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.38 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  20.91 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  38.54 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.49 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.43 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  31.94 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 		 398 aa  72.8  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 421 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  23.11 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  24.45 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  22.17 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 		 391 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2628  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 410 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00259804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 395 aa  72  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.18 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  27.54 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  24.45 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  27.54 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 		 743 aa  72  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.7 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>