More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0454 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
384 aa  801    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  27.99 
 
 
378 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
381 aa  110  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
385 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
391 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
378 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  27.85 
 
 
388 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.25 
 
 
381 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.83 
 
 
381 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.83 
 
 
381 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  29.83 
 
 
381 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  29.83 
 
 
381 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.25 
 
 
381 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  29.83 
 
 
381 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.83 
 
 
381 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 
373 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
381 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.41 
 
 
381 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
364 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
375 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
395 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 
378 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  34.39 
 
 
384 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  24.78 
 
 
376 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  36.14 
 
 
355 aa  101  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.31 
 
 
371 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
390 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
381 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
345 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
412 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1755  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
365 aa  100  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.33 
 
 
365 aa  99.8  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
412 aa  99  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 
371 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
391 aa  98.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  23.32 
 
 
364 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  24.49 
 
 
376 aa  98.2  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  37.23 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
398 aa  97.4  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 
383 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
401 aa  97.1  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  28.64 
 
 
377 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  29.12 
 
 
385 aa  96.7  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
374 aa  97.1  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  21.96 
 
 
408 aa  96.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
374 aa  96.3  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 
387 aa  96.7  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  26.04 
 
 
376 aa  96.7  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
371 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  25.32 
 
 
388 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 
403 aa  95.5  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
399 aa  95.5  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.2 
 
 
366 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 
373 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4266  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
412 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
368 aa  95.5  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
360 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
381 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 
390 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 
392 aa  94.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 
378 aa  94  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
409 aa  94  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
375 aa  94  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.44 
 
 
373 aa  93.6  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.21 
 
 
401 aa  93.6  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
386 aa  93.6  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4267  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 
406 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 
366 aa  93.2  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  29.95 
 
 
368 aa  92.8  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.38 
 
 
380 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1461  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
362 aa  92.4  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
379 aa  92.8  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1349  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
394 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
378 aa  92.8  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  31.03 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.68 
 
 
365 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.62 
 
 
407 aa  91.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.94 
 
 
419 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  22.75 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 
387 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
392 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1350  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  28.92 
 
 
388 aa  90.9  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
382 aa  90.9  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 
405 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
390 aa  91.3  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  27.73 
 
 
426 aa  90.9  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
360 aa  91.3  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
394 aa  90.9  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0914  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.16 
 
 
375 aa  90.5  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000157523  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
395 aa  90.5  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  34.71 
 
 
390 aa  90.1  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>