More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4007 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 390 aa  811    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0496  glycosyl transferase group 1  42.08 
 
 		 409 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3642  glycosyl transferase, group 1  41.93 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  39.04 
 
 		 406 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  38.4 
 
 		 412 aa  227  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3261  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2615  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 		 395 aa  155  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5063  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5113  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 		 382 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756342 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1798  glycosyltransferase  27.65 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0440  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 		 403 aa  97.1  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.438778  normal  0.0102055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  35.32 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 		 378 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  34.71 
 
 		 384 aa  90.1  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 396 aa  90.1  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  32.8 
 
 		 350 aa  88.6  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  36.5 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.38 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.35 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 689 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1413  glycosyl transferase, group 1  35.9 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.71517 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 1080 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.28 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  38.26 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  30.51 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2254  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0723451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.05 
 
 		 373 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  29.51 
 
 		 362 aa  76.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  35.37 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  34.62 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.51 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  34.62 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00660  glycosyltransferase  27.68 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.03 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  27.94 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.24 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2253  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.03 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12393  Glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  30.59 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.89 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.24 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  30.54 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  36.36 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>