More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0496 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0496  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
409 aa  814    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3642  glycosyl transferase, group 1  82.56 
 
 
411 aa  658    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  52.13 
 
 
406 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  42.08 
 
 
390 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  44.78 
 
 
412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3261  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
399 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5063  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
390 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5113  glycosyl transferase, group 1  33.59 
 
 
382 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2615  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  43.87 
 
 
407 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 
396 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  43.23 
 
 
405 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  43.23 
 
 
405 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  38.33 
 
 
404 aa  97.1  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2630  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
438 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451665  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  40.12 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  37.33 
 
 
378 aa  90.5  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  37.64 
 
 
390 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
375 aa  89.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  39.1 
 
 
406 aa  89.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
409 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
409 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  34.78 
 
 
379 aa  87.8  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.81 
 
 
407 aa  87  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1798  glycosyltransferase  28.7 
 
 
391 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  36.88 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  34.01 
 
 
410 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
376 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
414 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  36.25 
 
 
417 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  36.48 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  37.18 
 
 
406 aa  82.8  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  37.34 
 
 
412 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  36.9 
 
 
426 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
371 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  27.78 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
396 aa  82  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 
871 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 
358 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  40.46 
 
 
401 aa  80.5  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.65 
 
 
365 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 
367 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 
433 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  44.85 
 
 
439 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  38.96 
 
 
388 aa  79  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  31.14 
 
 
371 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  30.86 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  34 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  33.69 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  30.95 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  40.91 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  36.49 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0852  glycosyl transferase group 1  38.31 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 
373 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  37.78 
 
 
377 aa  77  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.71 
 
 
409 aa  77  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
374 aa  77  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
374 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
382 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
364 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  35.22 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1934  glycosyl transferase, group 1  37.91 
 
 
367 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.142623 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  35.95 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.96 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  33.66 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  35.44 
 
 
452 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 
467 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  37.41 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  40.91 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.29 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  33.66 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  35.95 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  39.67 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00194  hexosyltransferase  34.12 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  30.11 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>