More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1798 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1798  glycosyltransferase  100 
 
 
391 aa  795    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  35.45 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  35.95 
 
 
412 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
390 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  37.65 
 
 
360 aa  97.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2630  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
438 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451665  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
398 aa  95.5  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 
827 aa  90.1  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
383 aa  87.4  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  38.06 
 
 
389 aa  87  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 
871 aa  87  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  37.06 
 
 
394 aa  86.3  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0496  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
409 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  36.94 
 
 
411 aa  84.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  35.86 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3642  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  36.3 
 
 
409 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  37.06 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
419 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  36.18 
 
 
394 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  36.99 
 
 
406 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  37.91 
 
 
401 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  39.68 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  37.42 
 
 
418 aa  79.3  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  41.38 
 
 
372 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 
396 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5113  glycosyl transferase, group 1  36.99 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756342 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.55 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  37.96 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  36.97 
 
 
366 aa  77  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 
413 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  32.93 
 
 
816 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3261  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 
384 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
739 aa  76.3  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2956  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
468 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  30.1 
 
 
363 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
386 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  34.19 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.19 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  44.64 
 
 
407 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 
370 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
424 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.74 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  33.59 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  35.51 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0854  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0579816 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
452 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  34.01 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1022  hypothetical protein  35.16 
 
 
417 aa  73.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 
482 aa  73.2  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 
401 aa  72.8  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
453 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
819 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
387 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  38.17 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 
370 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 
368 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
820 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  32.16 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
396 aa  72  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  46.81 
 
 
388 aa  72  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 
750 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.97 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 
816 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  39.71 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  34.58 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>