More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0511 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  80.8 
 
 		 381 aa  645    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 381 aa  780    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  79.84 
 
 		 378 aa  636    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  76.27 
 
 		 383 aa  590  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  72.8 
 
 		 379 aa  566  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  69.41 
 
 		 380 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0690  glycosyl transferase group 1  69.68 
 
 		 385 aa  533  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.945195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  50.92 
 
 		 382 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  47.2 
 
 		 381 aa  346  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  46.9 
 
 		 379 aa  345  7e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4031  glycosyl transferase, group 1  47.72 
 
 		 387 aa  339  5e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.317277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  46.67 
 
 		 379 aa  338  7e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  45.38 
 
 		 381 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  45.12 
 
 		 381 aa  335  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  45.6 
 
 		 381 aa  334  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  45.6 
 
 		 381 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  45.6 
 
 		 381 aa  333  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  45.6 
 
 		 381 aa  333  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  45.6 
 
 		 381 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  45.6 
 
 		 381 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  45.41 
 
 		 375 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  45.6 
 
 		 381 aa  332  6e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  45.6 
 
 		 381 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  45.6 
 
 		 381 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1189  glycosyl transferase group 1  46.03 
 
 		 383 aa  331  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  46.56 
 
 		 378 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2479  glycosyl transferase group 1  45.87 
 
 		 380 aa  328  7e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0145757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  46.51 
 
 		 384 aa  324  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  43.7 
 
 		 378 aa  322  9.000000000000001e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  43.82 
 
 		 378 aa  320  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  42.86 
 
 		 377 aa  311  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  42.44 
 
 		 378 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  43.5 
 
 		 374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  43.86 
 
 		 380 aa  282  7.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  41.6 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  40.8 
 
 		 424 aa  271  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  39.15 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  39.15 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  38.76 
 
 		 421 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.67 
 
 		 380 aa  259  6e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  38.73 
 
 		 398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1166  glycosyl transferase group 1  38.07 
 
 		 370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.27899 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  31.1 
 
 		 401 aa  112  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 536 aa  112  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  27.6 
 
 		 426 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 		 370 aa  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 		 426 aa  106  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 		 355 aa  106  7e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 		 353 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 		 446 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 		 355 aa  103  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 		 411 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  27.67 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 382 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 		 374 aa  100  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 		 387 aa  99.4  8e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  40.69 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 396 aa  98.2  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 		 425 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0088  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 		 369 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.323047  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 371 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 		 392 aa  97.8  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 		 405 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 395 aa  96.7  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 		 394 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 374 aa  96.3  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 		 364 aa  96.3  7e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 410 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 419 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 		 408 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1755  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 		 365 aa  94.7  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 		 361 aa  94.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  23.57 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 		 412 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 		 387 aa  94  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 385 aa  93.6  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 		 376 aa  93.6  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 		 405 aa  93.2  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 		 439 aa  93.2  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 381 aa  93.2  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>