More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0293 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 406 aa  814    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  64.11 
 
 		 406 aa  543  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  66 
 
 		 411 aa  535  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  64.04 
 
 		 405 aa  527  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  59.55 
 
 		 405 aa  511  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  61.46 
 
 		 405 aa  491  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  54.32 
 
 		 416 aa  443  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  54.25 
 
 		 401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4821  glycosyl transferase, group 1  54.84 
 
 		 401 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726751  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  52.74 
 
 		 402 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  62.37 
 
 		 768 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  49.24 
 
 		 405 aa  362  7.0000000000000005e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4282  glycosyl transferase, group 1  36.98 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  36.54 
 
 		 564 aa  202  8e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  33.49 
 
 		 1188 aa  186  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  31.13 
 
 		 723 aa  186  7e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  34.07 
 
 		 557 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 		 575 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26850  glycosyltransferase  34.78 
 
 		 573 aa  172  7.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1851  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.93 
 
 		 400 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  32.85 
 
 		 569 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0635  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08970  glycosyltransferase  32.43 
 
 		 601 aa  150  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27990  glycosyltransferase  31.21 
 
 		 603 aa  149  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 		 414 aa  131  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  32.62 
 
 		 414 aa  131  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 		 411 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 		 536 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 		 393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  30.55 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  28.62 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 		 408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  27.99 
 
 		 416 aa  113  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 		 415 aa  113  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  27.58 
 
 		 397 aa  109  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  32.83 
 
 		 386 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.26 
 
 		 401 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.14 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  28.27 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 		 475 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 421 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 410 aa  99.8  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 		 408 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1187  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  33 
 
 		 436 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 375 aa  97.4  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  28.27 
 
 		 650 aa  97.8  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  27.58 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 		 394 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 		 417 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1593  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 		 403 aa  97.1  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.15 
 
 		 383 aa  96.3  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 426 aa  96.7  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 426 aa  95.5  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  27.66 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 		 430 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 		 517 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 		 904 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 381 aa  94.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 386 aa  94.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 		 439 aa  94.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  26.71 
 
 		 408 aa  94  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.44 
 
 		 385 aa  93.6  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 		 397 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 381 aa  94  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 		 376 aa  94  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 		 392 aa  93.6  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  22.88 
 
 		 378 aa  93.2  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  23.42 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  28.41 
 
 		 383 aa  92  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>