More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3107 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 475 aa  955    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  46.7 
 
 		 372 aa  295  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  41.73 
 
 		 415 aa  278  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  31.85 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.45 
 
 		 377 aa  167  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 		 390 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  30.98 
 
 		 382 aa  136  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  27.92 
 
 		 416 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.01 
 
 		 394 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  30.6 
 
 		 389 aa  118  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2797  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00591651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 		 405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 		 411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 		 406 aa  106  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  28.69 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 		 405 aa  104  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 904 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 		 406 aa  103  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  35.27 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  30.53 
 
 		 564 aa  100  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  31.38 
 
 		 1188 aa  100  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  33.03 
 
 		 373 aa  99.8  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  28.24 
 
 		 723 aa  98.2  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 		 575 aa  97.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 378 aa  97.1  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 		 409 aa  96.7  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 		 401 aa  95.5  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  24.39 
 
 		 401 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 398 aa  94.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  31.14 
 
 		 389 aa  94.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 		 403 aa  94.4  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 		 405 aa  94  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  24.06 
 
 		 397 aa  93.2  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4821  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726751  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 		 403 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 		 402 aa  90.9  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 		 417 aa  90.9  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 		 370 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 		 386 aa  90.1  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27990  glycosyltransferase  25.93 
 
 		 603 aa  90.1  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 		 390 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 		 375 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 768 aa  82.4  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 367 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  24.73 
 
 		 377 aa  79.7  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  24.33 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  26.4 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  26.61 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0993  putative cell division protease FtsH-like protein  24.72 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0355  glycosyl transferase, group 1  21.77 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  22.68 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.25 
 
 		 348 aa  76.6  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 376 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08970  glycosyltransferase  31.17 
 
 		 601 aa  76.6  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1489  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113053  normal  0.618426 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6507  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.961113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  21.75 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0777  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135676  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  22.37 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 378 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 		 403 aa  73.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>