More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2797 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2797  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
396 aa  741    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00591651  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  38.01 
 
 
390 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
390 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  40.1 
 
 
386 aa  250  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  45.36 
 
 
389 aa  228  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  40.78 
 
 
382 aa  204  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  40.25 
 
 
414 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  40.25 
 
 
414 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  41.29 
 
 
399 aa  189  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  38.38 
 
 
372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  37.87 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
398 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
390 aa  112  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
904 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1489  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 
395 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113053  normal  0.618426 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
535 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  23.39 
 
 
416 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  28.15 
 
 
404 aa  93.6  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.17 
 
 
377 aa  87.4  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
370 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  31.9 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1891  glycosyl transferase group 1  41.21 
 
 
382 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  34.02 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
424 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 
440 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.03 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  36.79 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.88 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  37.61 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  31.22 
 
 
406 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  28.46 
 
 
442 aa  79  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  35.51 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  39.51 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.34 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  36.17 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  35.82 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  33.33 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  32.54 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  24.42 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  27.97 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  24.39 
 
 
382 aa  72.8  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
445 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  38.79 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  24.42 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
458 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  37.06 
 
 
432 aa  70.5  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  22.56 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  37.26 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  34.45 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  39.05 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
426 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
382 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  34.96 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 
408 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 
408 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 
408 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  36.82 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.89 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  29.84 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 
439 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.47 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14970  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  37.04 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 
439 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 
439 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  24 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  36.82 
 
 
379 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  38.56 
 
 
379 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5069  glycosyl transferase group 1  39.38 
 
 
416 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
392 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 
351 aa  67  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  33.5 
 
 
404 aa  67  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
423 aa  67  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  35.09 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  29.61 
 
 
723 aa  66.6  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>