More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3471 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 390 aa  780    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1489  glycosyl transferase group 1  80.88 
 
 		 395 aa  629  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113053  normal  0.618426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  61.07 
 
 		 398 aa  468  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  52.27 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  32.11 
 
 		 414 aa  143  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 		 414 aa  143  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 		 399 aa  139  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 390 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 		 386 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  32.57 
 
 		 382 aa  123  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2797  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00591651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.12 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  28.34 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  30.53 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  23.75 
 
 		 416 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 		 394 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 		 904 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 		 385 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 394 aa  87  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 		 406 aa  86.7  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  28.05 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  31.19 
 
 		 557 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.08 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 		 475 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.09 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  30.77 
 
 		 569 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  34.81 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 		 407 aa  76.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  29.41 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4245  glycosyl transferase group 1  37.12 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4220  glycosyl transferase group 1  37.12 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 401 aa  72.8  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4095  glycosyl transferase, group 1  37.12 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 379 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  23.59 
 
 		 359 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 382 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 		 377 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1365  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  25.67 
 
 		 723 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0777  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135676  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  22.37 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  38.03 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  28.87 
 
 		 564 aa  69.7  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  19.49 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0330  glycosyl transferase group 1  37.4 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0196896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  43.04 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 575 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  23.12 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  25.51 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  45.33 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  27.42 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  19.92 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  22.28 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>