More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1839 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 362 aa  718    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  87.96 
 
 		 367 aa  628  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  53.3 
 
 		 385 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  45.97 
 
 		 367 aa  263  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  40.81 
 
 		 370 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  39.84 
 
 		 376 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  40.39 
 
 		 376 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  38.69 
 
 		 404 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  38.38 
 
 		 377 aa  229  8e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  40.67 
 
 		 381 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  40.67 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2637  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfbV  34.33 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0540  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.77 
 
 		 369 aa  216  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180191  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  37.74 
 
 		 379 aa  216  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2166  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.51 
 
 		 371 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  37.2 
 
 		 377 aa  203  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  35.39 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  36.83 
 
 		 382 aa  199  6e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 		 385 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  37.77 
 
 		 638 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  37.91 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4206  glycosyl transferase, group 1  38.17 
 
 		 376 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  34.84 
 
 		 378 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0964  glycosyl transferase, group 1  36.71 
 
 		 613 aa  176  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0495  glycosyl transferase group 1  34.7 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2891  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 		 378 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.32 
 
 		 370 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.65 
 
 		 423 aa  129  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 		 402 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  34.48 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  34.43 
 
 		 406 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 		 377 aa  122  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 		 376 aa  122  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  27.94 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  41.58 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 		 371 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  34.81 
 
 		 381 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  35.27 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 374 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 		 398 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 		 360 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  38.58 
 
 		 406 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.56 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 		 453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  33.33 
 
 		 407 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  37.89 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.69 
 
 		 409 aa  109  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1064  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 400 aa  109  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 419 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  33.43 
 
 		 388 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1772  group 1 glycosyl transferase  31.47 
 
 		 392 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 		 422 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4290  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  33.64 
 
 		 375 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.937919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 		 404 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 		 413 aa  106  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  30.23 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  29.78 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2374  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00997519 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 		 437 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  33.99 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 414 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  33.43 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 		 437 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  34.36 
 
 		 392 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 401 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.65 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  27.39 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5198  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 		 426 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.603506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 435 aa  102  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.94 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0966  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0155699  normal  0.836168 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  22.8 
 
 		 396 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>