More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2912 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  92.23 
 
 
412 aa  745    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
412 aa  837    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  98.79 
 
 
412 aa  831    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  76.21 
 
 
412 aa  594  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  77.67 
 
 
410 aa  568  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  59.23 
 
 
402 aa  455  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3427  glycosyl transferase group 1  51.15 
 
 
435 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000419175  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 
371 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 
408 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
367 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
426 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
396 aa  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1891  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
382 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
446 aa  106  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
410 aa  106  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
419 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  39.88 
 
 
396 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.04 
 
 
407 aa  105  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  34.95 
 
 
358 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
406 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
438 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
411 aa  103  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  41.48 
 
 
390 aa  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.75 
 
 
382 aa  103  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
398 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
482 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
409 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 
748 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
410 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
768 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 
458 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
397 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 
370 aa  100  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1630  glycosyl transferase, group 1  35.05 
 
 
418 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 
385 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 
415 aa  100  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  28.71 
 
 
414 aa  100  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  24.75 
 
 
401 aa  99.8  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 
430 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
439 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.21 
 
 
409 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
368 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4328  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.74 
 
 
381 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00438832  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
413 aa  97.8  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
439 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
439 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
360 aa  97.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  24.62 
 
 
382 aa  97.8  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
402 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  22.76 
 
 
394 aa  96.3  8e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
419 aa  96.3  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
394 aa  96.3  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
358 aa  95.5  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
381 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.93 
 
 
382 aa  95.9  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 
406 aa  95.5  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
423 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 
438 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
672 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
392 aa  95.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  22.45 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  37.84 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
353 aa  94.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
437 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
437 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
438 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
370 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
351 aa  94.4  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
420 aa  94.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  21.58 
 
 
355 aa  93.6  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
414 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
396 aa  94  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  27.41 
 
 
377 aa  93.6  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  23.38 
 
 
427 aa  93.2  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
417 aa  93.2  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 
363 aa  93.2  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
367 aa  93.2  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  27.82 
 
 
407 aa  93.2  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
372 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
409 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
371 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
448 aa  92.8  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
435 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
426 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 
392 aa  92.8  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
379 aa  92.8  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
430 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
435 aa  92.8  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  32.25 
 
 
406 aa  92.8  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
399 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 
434 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  26.72 
 
 
413 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  31.35 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
364 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  21.5 
 
 
355 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>