More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1630 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  83.21 
 
 
430 aa  701    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1630  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
418 aa  834    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2329  glycosyl transferase group 1  56.46 
 
 
419 aa  426  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0153585 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2957  glycosyl transferase group 1  50.84 
 
 
435 aa  426  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3362  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2749  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
393 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000830011 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  26.17 
 
 
404 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1131  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
411 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 
394 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  36.98 
 
 
412 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 
412 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
375 aa  100  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  19.48 
 
 
396 aa  100  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  34.54 
 
 
412 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
398 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
385 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  36.08 
 
 
426 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
414 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 
387 aa  97.1  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  27.9 
 
 
411 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 
435 aa  97.1  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.12 
 
 
388 aa  95.9  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 
373 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 
408 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 
408 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 
408 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 
346 aa  93.2  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 
360 aa  93.2  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  34.08 
 
 
353 aa  92  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
420 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  37.77 
 
 
748 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
413 aa  91.3  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
416 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3577  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
377 aa  90.9  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
373 aa  90.1  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  36.46 
 
 
377 aa  90.1  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2693  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
421 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
375 aa  89.4  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
446 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  33.83 
 
 
404 aa  89.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
362 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
395 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
383 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 
374 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  36.79 
 
 
367 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  31.25 
 
 
365 aa  87.8  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1230  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
413 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  31.95 
 
 
377 aa  87  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  27.73 
 
 
406 aa  87  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
419 aa  87  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 
412 aa  87  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 
391 aa  87  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  32.23 
 
 
382 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  32.23 
 
 
382 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
410 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
409 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  34.09 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
425 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  32.56 
 
 
411 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 
384 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  32.81 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  22.97 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
417 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  48 
 
 
409 aa  84.3  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  21.6 
 
 
392 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  26.7 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.13 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2575  glycosyl transferase, group 1  37.44 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.561026  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  31.62 
 
 
398 aa  84  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
391 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  35.98 
 
 
387 aa  84  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
385 aa  84  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  32.63 
 
 
387 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.68 
 
 
381 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  36.89 
 
 
414 aa  84  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 
379 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  28.43 
 
 
402 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  32.84 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  26.42 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  32.11 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 
410 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.68 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
398 aa  82.8  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.68 
 
 
381 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  38.68 
 
 
381 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  38.68 
 
 
381 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
382 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  42.37 
 
 
380 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
382 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
380 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>