More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1885 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 389 aa  787    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  36.5 
 
 		 371 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 		 395 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1066  glycosyl transferase group 1  38.06 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  31.93 
 
 		 365 aa  143  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  32.99 
 
 		 391 aa  139  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6431  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 		 380 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  26.79 
 
 		 350 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6235  glycosyl transferase group 1  35.27 
 
 		 381 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93613  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 		 351 aa  125  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.54 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 373 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0058  glycosyl transferase group 1  35.95 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145995  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 		 409 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  37.12 
 
 		 739 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  25.86 
 
 		 384 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 382 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4435  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 400 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 		 379 aa  96.3  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.55 
 
 		 407 aa  95.9  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 		 419 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 		 750 aa  93.6  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 		 412 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 		 405 aa  92.8  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  30.05 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 		 360 aa  89.7  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 398 aa  89.7  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.67 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 		 381 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 		 388 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 379 aa  87  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  38.75 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  26.89 
 
 		 363 aa  86.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 		 412 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.9 
 
 		 380 aa  86.3  8e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  27.9 
 
 		 377 aa  86.3  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  24.04 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 		 396 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.94 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0730  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 		 343 aa  82.8  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00119132  hitchhiker  0.00102221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2380  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1003  hypothetical protein  37.11 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.14 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.38 
 
 		 2401 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  32.08 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0925  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0790  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  24.52 
 
 		 427 aa  79.7  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 367 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>