More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0790 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0790  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
388 aa  785    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4435  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
400 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  29.62 
 
 
358 aa  92  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.01 
 
 
356 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4950  glycosyl transferase  23.79 
 
 
360 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00550219  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0287  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
406 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0870  a-glycosyltransferase  27.13 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.179475  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  21.37 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.22 
 
 
360 aa  80.1  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
407 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  25.4 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02940  polysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.41 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
373 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2959  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  32.95 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 
426 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2867  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1833  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6235  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93613  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  29.59 
 
 
650 aa  73.2  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 
426 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.41 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.47 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  32.79 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  24.28 
 
 
384 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  21.74 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
353 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  22.97 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.1 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  29.1 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1003  hypothetical protein  26.92 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2483  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0486018 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
422 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
1177 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
426 aa  66.2  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.57 
 
 
406 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
407 aa  66.2  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25631  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
374 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
386 aa  66.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 
398 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
391 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6431  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
380 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
417 aa  64.7  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
405 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
415 aa  63.5  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
417 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 
454 aa  63.5  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
367 aa  63.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
418 aa  63.2  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  37.2 
 
 
401 aa  62.8  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2124  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  28.25 
 
 
391 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0173  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 
411 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
1177 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
437 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  27.37 
 
 
406 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
394 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  26 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
421 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
568 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0925  glycosyl transferase group 1  38.53 
 
 
376 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  27.37 
 
 
406 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
409 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
400 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
435 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
417 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2368  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
409 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.374877  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  44.05 
 
 
426 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
371 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
403 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.63 
 
 
409 aa  60.5  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
419 aa  60.5  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 
385 aa  60.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
396 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 
386 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1846  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
415 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  33.63 
 
 
364 aa  60.1  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0177  Sucrose synthase  30.94 
 
 
792 aa  60.1  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
412 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>