More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1254 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
398 aa  790    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.77 
 
 
366 aa  127  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  34.73 
 
 
379 aa  126  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  43.41 
 
 
739 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  37.61 
 
 
377 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  41.34 
 
 
376 aa  122  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  38.04 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  37.1 
 
 
374 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 
376 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  39.49 
 
 
750 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  32.78 
 
 
394 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  37.66 
 
 
398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  37.02 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  30.85 
 
 
350 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  32.86 
 
 
360 aa  113  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
378 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
377 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  37.08 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  38.98 
 
 
373 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  24.27 
 
 
369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  31.81 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 
371 aa  110  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 
364 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 
409 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  38 
 
 
365 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
412 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0723  glycosyl transferase group 1  41.22 
 
 
381 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  40.35 
 
 
371 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2380  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 
371 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0812  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol  41.22 
 
 
381 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.4 
 
 
419 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  36.71 
 
 
370 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  37.71 
 
 
380 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  35.17 
 
 
821 aa  106  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  27.27 
 
 
745 aa  106  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 
385 aa  105  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  34.26 
 
 
359 aa  105  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
360 aa  106  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  33.58 
 
 
370 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  35.74 
 
 
370 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 
374 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  33.19 
 
 
401 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 
344 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 
364 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 
399 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
403 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  36.2 
 
 
745 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  38.12 
 
 
342 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 
382 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.35 
 
 
367 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  37.29 
 
 
380 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  38.55 
 
 
371 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
385 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 
385 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  41.42 
 
 
358 aa  103  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  36.23 
 
 
396 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
391 aa  103  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 
403 aa  103  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
374 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 
383 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  39.75 
 
 
374 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  34.32 
 
 
822 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  35.58 
 
 
360 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 
412 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
399 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.1 
 
 
365 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
364 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 
819 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  40.22 
 
 
453 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  37.02 
 
 
385 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
384 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
383 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
364 aa  100  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.67 
 
 
360 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
382 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
369 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3930  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
412 aa  99.8  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0476116 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
369 aa  99.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 
373 aa  99.8  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
386 aa  99.8  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  34.24 
 
 
388 aa  99.8  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2027  glycosyl transferase, group 1  38.41 
 
 
360 aa  99.4  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.65 
 
 
373 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
377 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  30 
 
 
346 aa  99.4  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 
383 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  36.32 
 
 
410 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  35.55 
 
 
373 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
344 aa  98.6  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  36.78 
 
 
361 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 
363 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
350 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
360 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 
821 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>